電離輻射對人舌鱗癌CAL-27細(xì)胞影響的生物信息學(xué)分析

摘要：通過生物信息學(xué)方法分析不同輻射源照射對人舌鱗癌CAL-27細(xì)胞基因表達(dá)譜的影響,為臨床篩選口腔腫瘤放射治療相關(guān)分子標(biāo)志物提供參考.利用X射線和重離子照射CAL-27細(xì)胞,運(yùn)用克隆存活實(shí)驗(yàn)及流式細(xì)胞術(shù)檢測細(xì)胞存活率及凋亡率;進(jìn)一步應(yīng)用高通量測序技術(shù)篩選受照射細(xì)胞差異表達(dá)的miRNAs,并對差異表達(dá)基因進(jìn)行生物學(xué)功能及代謝通路富集分析,以探討其分子損傷機(jī)理.結(jié)果表明,X射線及重離子照射CAL-27細(xì)胞后,細(xì)胞存活率分別為88%、71%,細(xì)胞凋亡率分別為13.9%、30.4%.通過高通量測序技術(shù)檢測分析發(fā)現(xiàn),與X射線輻照組相比,重離子輻照組共有33個miRNAs表達(dá)差異,其中有12個miRNAs表達(dá)上調(diào),21個miRNAs表達(dá)下調(diào);通過KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)數(shù)據(jù)庫在表達(dá)差異的miRNAs中篩選出了15條相關(guān)信號通路,如嗅覺傳導(dǎo)通路、細(xì)胞因子受體交互通路、絲裂原活化蛋白激酶信號通路等.結(jié)果提示,在相同吸收劑量條件下,相比于X射線,重離子輻射對CAL-27細(xì)胞miRNA表達(dá)譜的影響較大,其變化機(jī)理可能與MAPK信號傳導(dǎo)通路有關(guān).