水稻OsRSH基因家族的生物信息學分析

摘要：鳥苷(五)四磷酸,即(p)ppGpp(Guanosine tetraphosphate and pentaphosphate),是兩類相關核苷酸ppGpp和pppGpp的總稱,普遍存在于植物中。環境中光照、鹽、PH、UV、植物激素等條件的變化會引起植物中(p)ppGpp水平的改變。植物中(p)ppGpp的合成和水解是由一類叫RSH(RelA/SpoT homolog)的蛋白來完成。有研究發現RSH與植物生長、基因表達及脅迫應答等密切相關,且不同植物中RSH蛋白的種類、結構和表達方式各有不同。本研究利用Interpro、Clustal Omega、splitstree、Plant CARE、Rice xpro等生物工具,分別對水稻RSH家族各成員的蛋白結構進行比較,對它們在光照應答、組織特性表達和激素應答過程中存在的特異性和差異性進行系統的分析,對它們在植物體內的生物功能進行了初步的解析和預測。我們發現水稻Os RSH和擬南芥AtRSH在結構、功能和表達上具有高度相似性,在組織呈現特異性表達,參與激素應答過程,為今后深入開展水稻RSH基因家族的功能研究提供了一定的依據。