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    山楂Actin基因片段克隆及序列分析

    馬聚澤; 呂換男; 王海靜; 李曉潁; 劉建珍; 張立彬; 武軍凱 河北科技師范學院園藝科技學院; 河北秦皇島066600
    • 山楂
    • 肌動蛋白
    • 序列分析
    • 克隆

    摘要:依據GenBank中已知的薔薇科梨屬Actin基因的保守序列設計1對特異性引物,以山楂葉片總DNA和總RNA為模板,分別利用PCR和RT-PCR技術從山楂中克隆得到Actin基因的DN段和cDN段,測序得到山楂Actin基因DN段長度為1578bp,cDN段長度為1005bp,編碼334個氨基酸。生物信息學軟件分析表明,該核苷酸序列與蘋果、梨、桃的Actin基因同源性較高,分別為98%,97%,95%,而編碼的氨基酸序列與蘋果、梨、桃則完全相同,屬間具有很好的保守性。試驗克隆得到的基因為山楂Actin基因,命名為CpActin。進化樹分析結果進一步表明,該Actin序列與蘋果、梨、桃和草莓等親緣關系最近;半定量RT-PCR結果顯示,CpActin在山楂的葉片、花柱和花粉中能夠穩定表達,可作為山楂的內參基因。

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