腸道病毒71型3D蛋白潛在毒力位點的序列分析

摘要：目的分析不同臨床嚴重程度感染者腸道病毒71型的3D蛋白氨基酸序列,了解潛在毒力相關變異位點。方法從NCBI數據庫下載不同臨床嚴重程度C4亞型EV71感染者3D區核苷酸序列;對推導的氨基酸序列進行比對和分析,查找不同臨床嚴重程度病毒感染者在3D蛋白存在差異有統計學意義的氨基酸位點。結果共下載序列113株,其中來自于重癥及死亡患者序列共67株、輕癥患者序列46株。分析顯示病毒3D區的256位和370位氨基酸殘基,在不同臨床嚴重病例中的分布差異有統計學意義,其中部分重癥患者在256位為非異亮氨酸,部分輕癥患者在370位為非甘氨酸。結論 C4亞型EV71病毒的3D區256位和370位氨基酸的變異,可能與病毒毒力相關。