豬線粒體控制區微衛星(mtMs)變異及其分布特征

摘要：豬線粒體DNA長度因D-loop中mtMs序列重復數變異而不同。為闡明豬mtMs變異及其在不同群體中的分布特征,本研究對4個藏豬群體、八眉豬、煙臺黑豬及3個引入豬群體共164個個體mtDNA D-loop全序進行測定,并與GenBank中發表的相關序列進行比對,分析了其中的重復單元核苷酸變異、重復次數及其在各群體間的分布規律。結果表明,因重復單元“5’-TGCGTACACG-3’”第2~4和10位上堿基變異,豬mtMs形成了以其為核心序列的多種重復單元(R^A~R^G)組成的復合結構,重復數介于3~47之間。單一重復(R^A)組成的mtMs結構在各群體中表現出分布優勢,而大多數復合結構(R^AR^B)分布在國外選育群體中。藏豬的mtMs復合結構多達8個,R^AR~CR^E為其特有,另有5個與八眉豬共享。中國野豬和韓國地方豬種也有其特有mtMs結構。豐富的mtMs變異和特有結構與長期適應進化有關,本研究為地方豬種遺傳資源及適應性研究提供了標記工具和理論基礎。