四倍體棉花GAE基因家族的鑒定及其在棉纖維發育中的表達分析

摘要：【目的】通過對陸地棉及海島棉GAE基因家族進行全基因組分析,為深入研究GAE基因家族在棉纖維發育中的功能提供理論依據。【方法】利用生物信息學分析軟件,對GAE基因家族進行全基因組鑒定,根據轉錄組數據分析在纖維發育過程中的表達規律。【結果】陸地棉GhGAE家族包含21個成員,海島棉GbGAE家族有22個成員,分為3個亞組,多數Gh GAEs和Gb GAEs基因沒有內含子,共分布在12條染色體上。GAE氨基酸序列保守基序有4個,保守性較強,且GAE蛋白均定位于高爾基體膜。根據GAEs在陸地棉、海島棉纖維發育不同時期的表達變化,將其分為纖維起始期高表達、纖維伸長期高表達、次生壁增厚期高表達、全時期低表達4類模式。其中GhGAE01、GhGAE02、Gh GAE11、Gh GAE12在陸地棉中高水平表達,GbGAE01、Gb GAE02、GbGAE11、Gb GAE12在海島棉中高水平表達,推測這些基因可能在纖維發育過程中發揮著重要作用。【結論】上述結果為研究GAE基因家族在棉纖維發育中的功能提供了參考依據。