摘要：為了開發(fā)南酸棗植物的微衛(wèi)星分子標(biāo)記,本研究基于Illumina-HiSeq2000測序平臺(tái)對南酸棗葉片和果實(shí)的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行高通量測序。利用MISA軟件對獲得的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫進(jìn)行搜索與分析,共鑒別出15168個(gè)SSR位點(diǎn),SSR位點(diǎn)的發(fā)生頻率為25.52%,平均分布距離3.98kb,以單核苷酸重復(fù)類型相對比例最高,占總數(shù)的62.32%,二核苷酸重復(fù)類型和三核苷酸重復(fù)類型分別占18.74%和17.47%。利用GenScript在線軟件設(shè)計(jì)出150對SSR引物,以不同來源南酸棗4個(gè)無性系DNA樣品對150對SSR引物進(jìn)行擴(kuò)增效率檢驗(yàn),發(fā)現(xiàn)有115對引物可擴(kuò)增出清晰條帶,其中25對引物具有多態(tài)性。本研究結(jié)果表明,利用高通量測序技術(shù)開發(fā)南酸棗SSR分子標(biāo)記是一種簡單而高效的途徑,可為南酸棗的居群遺傳多樣性、遺傳結(jié)構(gòu)以及種質(zhì)資源鑒定研究奠定基礎(chǔ)。