基于SCoT分子標(biāo)記的48份楊桃種質(zhì)遺傳多樣性分析

摘要：【目的】分析48份楊桃種質(zhì)的遺傳多樣性,為楊桃種質(zhì)資源的鑒定保護(hù)及開(kāi)發(fā)利用提供理論依據(jù)。【方法】從60條SCoT引物中篩選出擴(kuò)增條帶清晰穩(wěn)定、多態(tài)性豐富的引物,對(duì)從國(guó)內(nèi)外收集的48份楊桃種質(zhì)材料進(jìn)行PCR擴(kuò)增,統(tǒng)計(jì)分析電泳圖譜,利用Popgene 1.32計(jì)算其遺傳多樣性參數(shù),采用NTSYSpc 2.1計(jì)算種質(zhì)間的遺傳相似系數(shù)和遺傳距離,利用UPGMA法進(jìn)行聚類(lèi)分析,并根據(jù)遺傳相似系數(shù)進(jìn)行主成分分析。【結(jié)果】從60條SCoT引物中篩選出的11條引物共擴(kuò)增出115條條帶,其中多態(tài)性條帶102條,占總條帶數(shù)的88.7%,每條SCoT引物擴(kuò)增的總條帶數(shù)(TNB)和多態(tài)性條帶數(shù)(NPB)分別為10.45和9.27條,多態(tài)性比率(PPB)為70.00%~100.00%,平均為88.84%;多態(tài)性信息量(PIC)、有效等位基因數(shù)(Ne)、Nei’s基因多樣性指數(shù)(H)和Shannon’s信息指數(shù)(I)的平均值分別為0.77、1.7758、0.4229和0.6061。48份楊桃種質(zhì)間的遺傳相似系數(shù)為0.4957~0.9217,平均為0.6841。聚類(lèi)分析結(jié)果顯示,在遺傳相似系數(shù)0.6618處可將48份楊桃種質(zhì)劃分為三大類(lèi)群,第Ⅰ類(lèi)群均為甜楊桃種質(zhì),第Ⅱ類(lèi)群以酸楊桃種質(zhì)為主,第Ⅲ類(lèi)群以甜楊桃種質(zhì)為主。主成分分析結(jié)果與聚類(lèi)分析結(jié)果基本一致,均與楊桃的果實(shí)風(fēng)味和種質(zhì)來(lái)源高度相關(guān)。【結(jié)論】楊桃種質(zhì)資源具有較豐富的遺傳多樣性,且篩選獲得的SCoT引物對(duì)楊桃種質(zhì)資源有較高的多態(tài)性檢測(cè)率,適用于楊桃種質(zhì)資源鑒別及親緣關(guān)系分析。