酒鬼酒發酵車間空氣源細菌系統發育多樣性研究

摘要：本研究采用空氣自然沉降法和純培養法從酒鬼酒發酵車間收集分離空氣中可培養細菌(含放線菌),運用基于16S rRNA基因序列的系統發育分析法對菌株進行多樣性研究。用添加10%酒鬼酒酒醅浸汁的營養瓊脂、麥芽膏-酵母膏和高氏一號培養基,從酒鬼酒發酵車間分離純化到127株細菌菌株。根據形態觀察和部分生理生化實驗去冗余,選取72株具有代表性的菌株,對其進行基于16S r RNA基因序列的系統發育多樣性分析。結果表明,這些分離菌株具有較高的類群多樣性,分屬于細菌域的4個門(Actinobacteria,Deinococcus-Thermus,Firmicutes,Proteobacteria)的17個科(Aurantimonadaceae,Bacillaceae,Bacillales FamilyⅫ,Corynebacteriaceae,Deinococcaceae,Intrasporangiaceae,Microbacteriaceae,Moraxellaceae,Nocardiaceae,Planococcaceae,Propionibacteriaceae,Pseudomonadaceae,Rhizobiaceae,Rhodobacteraceae,Sphingomonadaceae,Staphylococcaceae,Xanthomonadaceae)的24個屬(Acinetobacter,Agrococcus,Arsenicicoccus,Arthrobacter,Aurantimonas,Bacillus,Corynebacterium,Deinococcus,Exiguobacterium,Janibacter,Kocuria,Luteococcus,Microbacterium,Micrococcus,Paracoccus,Pararhodobacter,Pseudomonas,Rhodococcus,Shinella,Sphingomonas,Sporosarcina,Staphylococcus,Virgibacillus,Xanthomonas)。優勢類群為Actinobacteria門(34株,47.22%),其中Micrococcaceae為優勢科,含15株菌株;其次是Proteobacteria門(24株,33.33%)和Firmicutes門(11株,15.28%),還分離到3株屬于分類名稱尚未確定且目前根據《伯杰氏細菌手冊》暫稱為異常球菌-棲熱菌門(Deinococcus-Thermus)的細菌。這些菌株可分為53個物種,大部分菌株與其系統發育關系最密切的已知物種的典型菌株之間存在一定的遺傳差異(16S rRNA基因序列相似性為96.37%~99.88%)。其中至少有5株(JSM 2215019、JSM 2215034、JSM2215039、JSM 2215042和JSM 2215109)可能代表潛在的新的分類單元(potential new taxa),它們可能分別代表Sphingomonas,Corynebacterium,Arthrobacter,Paracoccus和Deinoc