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    青南高原多房棘球蚴myophilin基因的克隆和序列分析

    何順偉; 張耀剛; 李超群; 彭源; 魏曉星 青海大學(xué)生態(tài)環(huán)境工程學(xué)院; 青海大學(xué)醫(yī)學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)部; 青海西寧810016
    • 多房棘球蚴
    • 親肌肉抗原
    • 基因
    • 克隆
    • 序列

    摘要:目的 克隆多房棘球絳蟲(Em)的myophilin基因并對其序列進(jìn)行分析與預(yù)測。方法提取Em原頭節(jié)總RNA,采用RT-PCR技術(shù)擴(kuò)增myophilin基因,將PCR產(chǎn)物連接入p GM-T載體,轉(zhuǎn)化入DH 5α感受態(tài)細(xì)胞,挑選陽性克隆送測序。采用生物信息學(xué)軟件對測序結(jié)果進(jìn)行序列比對分析,同時預(yù)測編碼蛋白的理化性質(zhì)、二級結(jié)構(gòu)、三級結(jié)構(gòu)、翻譯后修飾位點、結(jié)構(gòu)域和抗原表位。結(jié)果 擴(kuò)增出長度為576 bp的cDN段,包含完整開放閱讀框(ORF),編碼190個氨基酸,與已知細(xì)粒棘球絳蟲的序列同源性達(dá)99%。預(yù)測結(jié)果顯示,編碼蛋白分子式為C_(935)H_(1519)N_(255)O_(285)S_(11),理論分子質(zhì)量為212 876,PI為8.66。α-螺旋、β-折疊和無規(guī)則卷曲在二級結(jié)構(gòu)中所占的比例分別為51.58%、10.00%和38.42%。含有10個翻譯后修飾位點,各1個Calponin結(jié)構(gòu)域和CH結(jié)構(gòu)域,8個B細(xì)胞抗原表位和6個T細(xì)胞抗原表位。結(jié)論 成功克隆出Em的myophilin基因并對其進(jìn)行了有效分析和預(yù)測。

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