青南高原多房棘球蚴myophilin基因的克隆和序列分析

摘要：目的 克隆多房棘球絳蟲（Em）的myophilin基因并對其序列進行分析與預測。方法提取Em原頭節(jié)總RNA,采用RT-PCR技術擴增myophilin基因,將PCR產(chǎn)物連接入p GM-T載體,轉化入DH 5α感受態(tài)細胞,挑選陽性克隆送測序。采用生物信息學軟件對測序結果進行序列比對分析,同時預測編碼蛋白的理化性質、二級結構、三級結構、翻譯后修飾位點、結構域和抗原表位。結果 擴增出長度為576 bp的cDN段,包含完整開放閱讀框（ORF）,編碼190個氨基酸,與已知細粒棘球絳蟲的序列同源性達99%。預測結果顯示,編碼蛋白分子式為C_（935）H_（1519）N_（255）O_（285）S_（11）,理論分子質量為212 876,PI為8.66。α-螺旋、β-折疊和無規(guī)則卷曲在二級結構中所占的比例分別為51.58%、10.00%和38.42%。含有10個翻譯后修飾位點,各1個Calponin結構域和CH結構域,8個B細胞抗原表位和6個T細胞抗原表位。結論 成功克隆出Em的myophilin基因并對其進行了有效分析和預測。