病毒性肝炎肝硬化發病關鍵基因及相互作用的生物信息學研究

摘要：目的篩選病毒性肝炎肝硬化發生發展中的關鍵基因,分析其相互之間的作用。方法本研究從公共基因芯片數據庫(GEO)下載病毒性肝炎肝硬化相關芯片數據,利用R語言中相關軟件篩選出表達差異基因,分別對差異基因進行Gene Ontology功能分析、KEGG代謝通路分析以及蛋白相互作用網絡分析。結果本研究從GEO數據庫中篩選出2組基因芯片進行分析,發現共同差異基因307個,其中上調基因62個、下調基因245個。富集分析表明差異基因在信號傳導、免疫反應等方面與肝硬化的發生發展有關,通過粘著斑通路、細胞黏附分子通路有關影響其進程;并篩選得到HLA-DMA、MYL9、COL3A1、C1QA等28個與肝硬化發病關系密切的基因、構建了相應的蛋白相互作用網絡。結論利用生物信息學方法能有效的分析基因芯片數據、篩選出目標基因,為病毒性肝炎肝硬化的防治、診斷和治療等提供新的思路和相關靶點。