<cite id="yyiou"><tbody id="yyiou"></tbody></cite>
<cite id="yyiou"><samp id="yyiou"></samp></cite>
  • <s id="yyiou"></s><bdo id="yyiou"><optgroup id="yyiou"></optgroup></bdo>
  • <cite id="yyiou"><tbody id="yyiou"></tbody></cite>

    首頁 > 期刊 > 自然科學(xué)與工程技術(shù) > 醫(yī)藥衛(wèi)生科技 > 醫(yī)藥衛(wèi)生綜合 > 山西醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào) > 通過生物信息學(xué)方法構(gòu)建調(diào)控網(wǎng)絡(luò)篩選前列腺癌關(guān)鍵基因 【正文】

    通過生物信息學(xué)方法構(gòu)建調(diào)控網(wǎng)絡(luò)篩選前列腺癌關(guān)鍵基因

    葉蕓; 劉冰; 相蓮; 袁小華; 王雨琛; 李蘇亮 西安醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院輸血科; 西安710077
    • 前列腺癌
    • 調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
    • 關(guān)鍵基因
    • 生物信息學(xué)

    摘要:目的利用生物信息學(xué)方法揭示和研究與前列腺癌(PCa)相關(guān)的分子機(jī)制中潛在功能基因。方法從GEO數(shù)據(jù)庫的GSE64318和GSE46602數(shù)據(jù)集獲得原始基因表達(dá)譜,使用以R軟件limma包為基礎(chǔ)在線工具GEO2R對(duì)兩組基因表達(dá)進(jìn)行差異分析。通過預(yù)測(cè)差異表達(dá)的miRNA,mRNA和lncRNA之間的相互作用及作用靶基因,構(gòu)建mRNA-miRNA-lncRNA相互作用網(wǎng)絡(luò)。對(duì)差異表達(dá)的miRNA和miRNA的靶基因進(jìn)行GO分析和KEGG通路富集分析并構(gòu)建蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)。結(jié)果研究結(jié)果表明60個(gè)miRNAs、1 578個(gè)mRNAs和61個(gè)lncRNAs在PCa中有差異表達(dá)。mRNA-miRNA-lncRNA網(wǎng)絡(luò)由5個(gè)miRNA、13個(gè)lncRNA和45個(gè)mRNA組成。差異表達(dá)基因主要富集于細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì),參與調(diào)控轉(zhuǎn)錄,與序列特異性DNA結(jié)合相關(guān),并且參與調(diào)控PI3K-Akt信號(hào)通路,這些通路與癌癥和局灶性粘連信號(hào)通路有關(guān)。此外,6個(gè)mRNA(EGFR、VEGFA、PIK3R1、DLG4、TGFBR1和KIT)在相互作用網(wǎng)絡(luò)中發(fā)揮著重要的調(diào)控作用。結(jié)論通過建立和分析前列腺癌調(diào)控網(wǎng)絡(luò),為進(jìn)一步研究前列腺癌的發(fā)生過程及其發(fā)展提供了有價(jià)值的線索。

    注:因版權(quán)方要求,不能公開全文,如需全文,請(qǐng)咨詢雜志社

    投稿咨詢 免費(fèi)咨詢 雜志訂閱

    我們提供的服務(wù)

    服務(wù)流程: 確定期刊 支付定金 完成服務(wù) 支付尾款 在線咨詢
    主站蜘蛛池模板: 武乡县| 永新县| 南川市| 神木县| 仪陇县| 兰西县| 嘉鱼县| 南通市| 镇平县| 万州区| 若尔盖县| 鹤庆县| 吉水县| 海伦市| 于田县| 呼图壁县| 鄂伦春自治旗| 东山县| 芒康县| 靖边县| 福州市| 平远县| 龙井市| 宝清县| 宜宾市| 米易县| 香格里拉县| 乌什县| 武胜县| 贵州省| 苍南县| 美姑县| 遂昌县| 左云县| 剑川县| 克东县| 宁明县| 古浪县| 易门县| 大城县| 阿坝|