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    首頁 > 期刊 > 自然科學與工程技術 > 農業科技 > 畜牧與動物醫學 > 畜禽業 > 雉雞SSR分子標記開發 【正文】

    雉雞SSR分子標記開發

    趙樂樂; 邢磊; 袁紅艷; 陸雪林 上海市動物疫病預防控制中心; 上海201103; 上海欣灝珍禽育種有限公司; 上海201408
    • 雉雞
    • ssr分子標記
    • ssr富集文庫
    • 454高通量測序

    摘要:目的進行雉雞SSR分子標記的開發。方法在雉雞分子標記未知的情況下,采用454測序平臺結合SSR富集文庫測序的高通量測序方法進行雉雞SSR分子標記的開發,對測序數據進行分析與篩選。結果獲得如下結果:①原始數據經質量過濾后的總reads數為289008條,總堿基數為109667298個,含有SSR位點的序列數為48168條;②單核苷酸重復SSR到六核苷酸重復SSR在雉雞基因組中均有分布。其中單核苷酸重復SSR數目最多,達25648個,占SSR位點總數的39.33%;雙核苷酸和三核苷酸SSR數量亦較豐富,分別為19618和9299個,占SSR位點總數的30.08%和14.26%;而四核苷酸至六核苷酸重復SSR數目較少,三者的總和為10651個,其中六核苷酸重復序列最少,僅為603個。結論通過雉雞SSR分子標記數據庫的構建,為雉雞種質資源遺傳多樣性分析、分子標記輔助育種、遺傳圖譜構建和功能基因的挖掘等提供了有利工具。

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