結(jié)核分枝桿菌Wag31蛋白的生物信息學分析

摘要：目的運用生物信息學方法預測分析結(jié)核分枝桿菌Rv2145c基因編碼蛋白Wag31的結(jié)構(gòu)與功能。方法由NCBI數(shù)據(jù)庫中獲得Rv2145c基因及蛋白Wag31的編碼序列,運用ProtParam及ProtScale對Wag31蛋白的基本理化特性及親疏水性進行預測分析;運用NetPhos、TMHMM及SignalP 4.1分析Wag31的磷酸化位點、跨膜區(qū)結(jié)構(gòu)及信號肽;分別運用SOPMA、SWISS-MODEL、ABCpred以及SYFPEITHI等工具預測Wag31蛋白的二級、三級結(jié)構(gòu)以及抗原表位;運用STRING預測Wag31蛋白的相互作用蛋白,并進行富集分析。結(jié)果細胞壁合成蛋白Wag31由260個氨基酸組成,分子式為C1200H1946N370O410S5,相對分子質(zhì)量28.277 18×103,屬于不穩(wěn)定蛋白,具有親水性;蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)分析顯示,無規(guī)則卷曲(Cc)占24.23%,α-螺旋(Hh)、β-折疊(Ee)和β-轉(zhuǎn)角(Tt)含量分別占73.08%、1.54%和1.15%。Wag31蛋白無信號肽和跨膜區(qū)結(jié)構(gòu),具有20個磷酸化優(yōu)勢位點,預測該蛋白含有25個B細胞抗原優(yōu)勢表位以及11個CTL細胞抗原優(yōu)勢表位;Wag31蛋白與GarA、PknA、PknB、FtsZ等蛋白相互作用,并參與多種生物過程。結(jié)論生物信息學分析Wag31蛋白具有潛在的B、T細胞抗原表位,能夠磷酸化并與多種蛋白相互作用,可為研發(fā)結(jié)核病疫苗的候選蛋白。