利用轉錄組測序鑒定玉米白色籽粒突變基因PDS

摘要：為探討轉錄組測序在玉米質量性狀基因克隆上的應用,以玉米自交系B73籽粒表現(xiàn)為白色的EMS突變體為材料,對該突變體授粉后15 d的籽粒進行轉錄組分析。通過與玉米B73參考基因組序列的比對分析,共鑒定到138個突變位點,其中51個突變位點對基因的功能有顯著影響。通過基因功能注釋與分類,發(fā)現(xiàn)該突變體在類胡蘿卜素合成途徑中的八氫番茄紅素去飽和酶基因(PDS)發(fā)生無義突變,導致PDS蛋白翻譯提前終止,阻斷類胡蘿卜素代謝途徑中有色體番茄紅素的生物合成,造成玉米籽粒白化。這些結果表明利用轉錄組測序技術能夠快速準確地鑒定玉米EMS突變體的突變基因。