首頁 > 期刊 > 自然科學(xué)與工程技術(shù) > 農(nóng)業(yè)科技 > 水產(chǎn)和漁業(yè) > 中國水產(chǎn)科學(xué) > 大黃魚雌雄性腺長(zhǎng)鏈非編碼RNA的挖掘與差異分析 【正文】
大黃魚雌雄性腺長(zhǎng)鏈非編碼RNA的挖掘與差異分析
王偉佳; 韓兆方; 李完波; 王志勇 集美大學(xué)農(nóng)業(yè)農(nóng)村部東海海水健康養(yǎng)殖重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 福建廈門361021; 青島海洋科學(xué)與技術(shù)試點(diǎn)國家實(shí)驗(yàn)室; 海洋漁業(yè)科學(xué)與食物產(chǎn)出過程功能實(shí)驗(yàn)室; 山東青島266071
- 大黃魚
- 性腺
- lncrna
- 性別分化
摘要：為探究長(zhǎng)鏈非編碼RNA在大黃魚性腺發(fā)育與分化中的作用,從雌雄各3尾大黃魚(Larimichthys crocea)的性腺中提取總RNA,進(jìn)行去除rRNA的鏈特異性轉(zhuǎn)錄組建庫和二代測(cè)序。將測(cè)序數(shù)據(jù)比對(duì)到大黃魚參考基因組,經(jīng)比對(duì)、組裝共得到來自31675個(gè)基因的66088個(gè)轉(zhuǎn)錄本,嚴(yán)格篩選得到來自3984個(gè)基因位點(diǎn)的5162條lncRNA。進(jìn)一步分析獲得了在大黃魚雌雄性腺中差異表達(dá)的mRNA 9341個(gè),lncRNA 2782個(gè),高度相關(guān)的lncRNA-mRNA對(duì)1227個(gè);有多個(gè)lncRNA靶向已知的性別分化和發(fā)育相關(guān)基因,其中l(wèi)ncRNA MSTRG.24346與大黃魚的性別決定候選基因dmrt1距離相近,且相關(guān)性極顯著。該研究表明lncRNA可能在大黃魚性別分化中起到重要作用,值得深入研究闡明機(jī)制。
- 大黃魚
- 性腺
- lncrna
- 性別分化
摘要：為探究長(zhǎng)鏈非編碼RNA在大黃魚性腺發(fā)育與分化中的作用,從雌雄各3尾大黃魚(Larimichthys crocea)的性腺中提取總RNA,進(jìn)行去除rRNA的鏈特異性轉(zhuǎn)錄組建庫和二代測(cè)序。將測(cè)序數(shù)據(jù)比對(duì)到大黃魚參考基因組,經(jīng)比對(duì)、組裝共得到來自31675個(gè)基因的66088個(gè)轉(zhuǎn)錄本,嚴(yán)格篩選得到來自3984個(gè)基因位點(diǎn)的5162條lncRNA。進(jìn)一步分析獲得了在大黃魚雌雄性腺中差異表達(dá)的mRNA 9341個(gè),lncRNA 2782個(gè),高度相關(guān)的lncRNA-mRNA對(duì)1227個(gè);有多個(gè)lncRNA靶向已知的性別分化和發(fā)育相關(guān)基因,其中l(wèi)ncRNA MSTRG.24346與大黃魚的性別決定候選基因dmrt1距離相近,且相關(guān)性極顯著。該研究表明lncRNA可能在大黃魚性別分化中起到重要作用,值得深入研究闡明機(jī)制。
注：因版權(quán)方要求，不能公開全文，如需全文，請(qǐng)咨詢雜志社
中國水產(chǎn)科學(xué)
- 預(yù)計(jì)1-3個(gè)月 預(yù)計(jì)審稿周期
- 0.96 影響因子
- 農(nóng)業(yè) 快捷分類
- 月刊 出版周期
主管單位：中華人民共和國農(nóng)業(yè)農(nóng)村部;主辦單位：中國水產(chǎn)科學(xué)研究院;中國水產(chǎn)學(xué)會(huì);中國科技出版?zhèn)髅焦煞萦邢薰?/p>
