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    首頁 > 期刊 > 自然科學與工程技術 > 農業科技 > 水產和漁業 > 中國水產科學 > 大黃魚雌雄性腺長鏈非編碼RNA的挖掘與差異分析 【正文】

    大黃魚雌雄性腺長鏈非編碼RNA的挖掘與差異分析

    王偉佳; 韓兆方; 李完波; 王志勇 集美大學農業農村部東海海水健康養殖重點實驗室; 福建廈門361021; 青島海洋科學與技術試點國家實驗室; 海洋漁業科學與食物產出過程功能實驗室; 山東青島266071
    • 大黃魚
    • 性腺
    • lncrna
    • 性別分化

    摘要:為探究長鏈非編碼RNA在大黃魚性腺發育與分化中的作用,從雌雄各3尾大黃魚(Larimichthys crocea)的性腺中提取總RNA,進行去除rRNA的鏈特異性轉錄組建庫和二代測序。將測序數據比對到大黃魚參考基因組,經比對、組裝共得到來自31675個基因的66088個轉錄本,嚴格篩選得到來自3984個基因位點的5162條lncRNA。進一步分析獲得了在大黃魚雌雄性腺中差異表達的mRNA 9341個,lncRNA 2782個,高度相關的lncRNA-mRNA對1227個;有多個lncRNA靶向已知的性別分化和發育相關基因,其中lncRNA MSTRG.24346與大黃魚的性別決定候選基因dmrt1距離相近,且相關性極顯著。該研究表明lncRNA可能在大黃魚性別分化中起到重要作用,值得深入研究闡明機制。

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