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    基于聚類分析的肺癌與基因相關關系研究

    任雪菁; 安新穎; 范少萍 北京協(xié)和醫(yī)學院/中國醫(yī)學科學院醫(yī)學信息研究所; 北京100020
    • 肺癌
    • 基因
    • 文本挖掘
    • 數(shù)據(jù)挖掘
    • 聚類分析

    摘要:目的:研究與不同類型肺癌存在關聯(lián)的基因及其與肺癌的關聯(lián),為肺癌相關基因領域的研究學者提供參考。方法:通過對肺癌、基因進行命名實體識別、實體數(shù)據(jù)的標準化處理、肺癌-基因矩陣構建、肺癌-基因矩陣的聚類分析、文獻回溯等,基于聚類的方法發(fā)現(xiàn)不同類型肺癌存在關聯(lián)的基因及其在肺癌不同階段的具體關聯(lián)。結果:利用聚類分析的方法將肺癌大致分為A549 lung cancer,Advanced non-small-cell lung cancer,small cell lung carcinoma四大類。高頻基因主要是EGFR(在晚期非小細胞肺癌患者體內突變率較高)、P53(主要在NSCLC晩期患者中高水平突變表達)、KRAS(主要與NSCLC有關)。結論:基因、蛋白質、化學物質等實體對肺癌的產(chǎn)生與治療至關重要。深入探究肺癌與基因的關系對肺癌的預防、診斷、治療均有重要意義。

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