網(wǎng)紋蟒非入侵式采樣和線粒體基因組分析

摘要：采用非入侵式采樣,提取網(wǎng)紋蟒Python reticulatus糞便和新鮮蛇蛻的基因組,探討非入侵式采樣在蛇類研究中的可能性。利用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)測(cè)定和拼接網(wǎng)紋蟒線粒體基因組全序列,結(jié)合GenBank中蟒科Pythonidae線粒體基因組全序列,對(duì)蟒科物種進(jìn)行比較分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn):蛇蛻中提取的DNA優(yōu)于糞便,液氮處理能提高DNA質(zhì)量濃度。網(wǎng)紋蟒線粒體基因組全長(zhǎng)17 641 bp,基因排布和結(jié)構(gòu)同蟒科物種一致,但部分基因起始密碼子和終止密碼子存在差異。根據(jù)系統(tǒng)發(fā)育樹分析推測(cè),與蚺科Boidae相比,蟒科和閃鱗蛇科Xenopeltidae進(jìn)化關(guān)系更接近。對(duì)蛇類物種進(jìn)化過程的分析發(fā)現(xiàn):熱點(diǎn)區(qū)域存在2個(gè)相似度非常高的控制區(qū),系統(tǒng)樹上的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)呈簇狀排列,推測(cè)2個(gè)控制區(qū)的結(jié)構(gòu)來源于一個(gè)祖先。這種種內(nèi)進(jìn)化的模式為協(xié)同進(jìn)化。圖3表2參15。