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    2016—2018年四川地區(qū)豬流行性腹瀉病毒流行病學(xué)調(diào)查與ORF3、S1部分基因序列分析

    德西措姆; 王印; 楊澤曉; 姚學(xué)萍; 羅燕; 廖倡宇; 張鵬飛; 江地科; 項明源; 姜瑞姣; 宋勇 昌都市左貢縣畜牧站; 西藏昌都854499; 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)動物醫(yī)學(xué)院; 動物疫病與人類健康四川省重點實驗室; 四川成都611130; 天津瑞普生物技術(shù)股份有限公司; 天津300300
    • 豬流行性腹瀉病毒
    • 流行病學(xué)調(diào)查
    • 基因序列分析

    摘要:為分析四川地區(qū)豬流行性腹瀉流行狀況及分子遺傳演化特征,對2016年6月至2018年6月收集的71份豬腹瀉病例進(jìn)行RT-PCR檢測與相關(guān)的流行病學(xué)調(diào)查,并對其中4份陽性樣品進(jìn)行ORF3、S1基因的檢測與序列分析。結(jié)果顯示,近2年的發(fā)病高峰日分別在1月28日和2月11日,發(fā)病高峰期在12月至3月;豬場連年感染數(shù)量下降,新疫源地增加;ORF3基因可分為2個基因型,部分毒株發(fā)生少量堿基突變;從S1基因高變區(qū)段分型結(jié)果顯示,2016年底至2018年初流行的PEDV毒株為GⅡ群,與目前流行的PEDV變異毒株在同一分支,同源性為92.8%~99.3%,堿基變異數(shù)量較大,與國內(nèi)的經(jīng)典疫苗株CV777親緣關(guān)系較遠(yuǎn),同源性為82.7%~87.3%,發(fā)病時期更集中,較傳統(tǒng)PEDV有輕度后移。結(jié)果表明,四川地區(qū)規(guī)模化豬場PED發(fā)病率呈下降趨勢,對于該病的防控取得初步成效。目前流行PEDV毒株有變異的趨勢,為PEDV的防控奠定基礎(chǔ)。

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