基因組學(xué)方法精品(七篇)

序論：寫作是一種深度的自我表達(dá)。它要求我們深入探索自己的思想和情感，挖掘那些隱藏在內(nèi)心深處的真相，好投稿為您帶來(lái)了七篇基因組學(xué)方法范文，愿它們成為您寫作過(guò)程中的靈感催化劑，助力您的創(chuàng)作。

篇(1)

關(guān)鍵詞：藥物基因組學(xué)；中藥；基因組技術(shù)

中圖分類號(hào)：[R932] 文獻(xiàn)標(biāo)志碼：A 文章編號(hào)：1674-9324（2013）44-0160-02

中藥是中華民族的瑰寶，隨著生物科技的發(fā)展，我們也越來(lái)越關(guān)注運(yùn)用現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)對(duì)中藥進(jìn)行全面研究。基因組學(xué)是20世紀(jì)末發(fā)展起來(lái)的一門科學(xué)，隨著人類基因組計(jì)劃的完成及后基因組時(shí)代的到來(lái)，藥物基因組（Pharmacogenomics），即研究遺傳變異與藥物反應(yīng)相互關(guān)系的一門學(xué)科，是以提高藥物的療效和安全為目標(biāo)，已成為新的研究重點(diǎn)。藥物基因組學(xué)的發(fā)展為中藥現(xiàn)代化提供了良好契機(jī)。

一、基因組學(xué)概述

1.基因組學(xué)定義。基因組學(xué)（Genomics）是研究基因組的科學(xué)，它以分子生物學(xué)、電子計(jì)算機(jī)和信息網(wǎng)絡(luò)技術(shù)為研究手段，以生物體內(nèi)全部基因?yàn)檠芯繉?duì)象，在全基因組背景下和整體水平上探索生命活動(dòng)內(nèi)在規(guī)律及內(nèi)在環(huán)境對(duì)機(jī)體影響機(jī)制的科學(xué)。它從全基因組的整體水平，而不是單個(gè)水平，來(lái)研究生命這一具有自組織和自裝配特性的復(fù)雜系統(tǒng)，認(rèn)識(shí)生命活動(dòng)的規(guī)律，從而將更加接近生命的本質(zhì)和面貌。

2.基因組研究?jī)?nèi)容。基因組學(xué)作為一門新興學(xué)科，根據(jù)其研究對(duì)象，研究的重點(diǎn)及研究的目的不同，又分成多分支學(xué)科。根據(jù)研究的重點(diǎn)不同，基因組學(xué)可以分為結(jié)構(gòu)基因組學(xué)和功能基因組學(xué)，結(jié)構(gòu)基因組學(xué)以全基因組測(cè)序?yàn)槟繕?biāo)，而功能基因組學(xué)以基因功能鑒定為目標(biāo)。根據(jù)研究的對(duì)象不同還可將基因組學(xué)分為疾病基因組學(xué)、比較基因組學(xué)、藥物基因組學(xué)和環(huán)境基因組學(xué)等。基因組研究可以理解為：①基因表達(dá)概況研究，即比較不同組織和不同發(fā)育階段、正常狀態(tài)與疾病狀態(tài)，以及體外培養(yǎng)的細(xì)胞中基因表達(dá)模式的差異，技術(shù)包括傳統(tǒng)的RTPCR，RNase保護(hù)試驗(yàn)，RNA印跡雜交等。②基因產(chǎn)物-蛋白質(zhì)功能研究，包括單個(gè)基因的蛋白質(zhì)體外表達(dá)方法，以及蛋白質(zhì)組研究。③蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)相互作用的研究，利用酵母雙雜交系統(tǒng)，單雜交系統(tǒng)（one-hybrid system），三雜交系統(tǒng)（thrdee-hybrid system）以及反向雜交系統(tǒng)（reverse hybrid system）等。

二、中藥研究中常用的基因組技術(shù)

1.基因芯片技術(shù)。基因芯片又稱DNA芯片（DNA chip）、DNA微陣列，是基于核酸、探針互補(bǔ)雜交技術(shù)原理，將大量的寡核酸片段按預(yù)先設(shè)定的排列順序固化在載體表面如硅片或玻片上，并以此為探針，在一定的條件下與樣品中的待測(cè)的靶基因片段或DNA序列雜交，通過(guò)檢測(cè)雜交信號(hào)的強(qiáng)度及分布來(lái)實(shí)現(xiàn)對(duì)靶序列信息的快速檢測(cè)和分析。目前已成為基因表達(dá)分析的最常用工具。基因芯片技術(shù)具有高通量、并行、高內(nèi)涵的特點(diǎn)，這就為探索中藥作用機(jī)理開辟了新領(lǐng)域。現(xiàn)代藥理學(xué)分子水平研究表明藥物作用都有其靶點(diǎn)，基因芯片可以確定靶組織的基因表達(dá)模式，從而將中藥作用的靶基因全部顯示出來(lái)。如陳明偉利用基因芯片技術(shù)檢測(cè)中藥單體人參皂苷20（R）Rg3對(duì)腫瘤血管生長(zhǎng)調(diào)控因子（VEGF）蛋白表達(dá)的抑制作用。基因芯片技術(shù)還有助于確定中藥有效部位，通過(guò)基因芯片技術(shù)迅速篩選起作用的中藥有效成分。此外，基因芯片技術(shù)在中藥材鑒定，道地藥材篩選，中藥新藥研發(fā)等方面都有重要的應(yīng)用。

2.DNA分子標(biāo)記技術(shù)。①RAPD技術(shù)。RAPD即隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA，在1990年由Welsh與Williams等人發(fā)展起來(lái)，是建立在PCR（Polymerase Chain Reaction）基礎(chǔ)之上的一種可對(duì)整個(gè)未知序列的基因組進(jìn)行多態(tài)性分析的分子技術(shù)。其以基因組DNA為模板，以單個(gè)人工合成的隨機(jī)多態(tài)核苷酸序列（通常為10個(gè)堿基對(duì)）為引物，在熱穩(wěn)定的DNA聚合酶作用下，進(jìn)行PCR擴(kuò)增。RAPD技術(shù)能快捷地辨別出不同遺傳物質(zhì)之間最微小的DNA偏差，而且耗材較少，不必提前獲知其基因堿基順序，通過(guò)對(duì)遺傳資源的分析，從遺傳多樣性中得到詳盡的遺傳信息。現(xiàn)在，RAPD技術(shù)已成功鑒定細(xì)辛、蒲公英、龍膽草、人參及西洋參等藥材。②RELP技術(shù)。RELP技術(shù)即限制性長(zhǎng)度多態(tài)性分析技術(shù)，就是將DN段用限制性內(nèi)切酶消化后，進(jìn)行限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性分析。RELP技術(shù)可以確定基因種屬的特異性和藥材的鑒定。陳美蘭采用PCR-RFLP方法從分子水平鑒定人參中有效成分人參皂苷的含量，克服了因人參分布易受生長(zhǎng)環(huán)境、儲(chǔ)存條件和加工等諸因素影響，采用傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)和組織學(xué)方法難以鑒別的缺點(diǎn)。

3.PCR技術(shù)。PCR技術(shù)即聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)技術(shù)，是體外擴(kuò)增DNA序列的技術(shù)，廣泛應(yīng)用于目的基因的制備等幾乎所有的分子生物學(xué)領(lǐng)域。DNA的保存需要嚴(yán)格的條件，在正常的中藥材加工和儲(chǔ)存過(guò)程中是很難做到的。王嚴(yán)明等通過(guò)PCR技術(shù)從保存了9年的藥材龜板中提取DNA，成功進(jìn)行了DNA指紋鑒定。

4.DNA測(cè)序技術(shù)。DNA測(cè)序技術(shù)，即測(cè)定DNA序列的技術(shù)。在分子生物學(xué)研究中，DNA的序列分析是進(jìn)一步研究和改造目的基因的基礎(chǔ)。該技術(shù)包括單向測(cè)序（Single-Read Sequencing），雙向測(cè)序（Paied-End Sequencing）混合樣品測(cè)序（Indexed Sequencing）。DNA測(cè)序技術(shù)在中藥品質(zhì)研究中有重要的應(yīng)用，劉玉萍等采用PCR直接測(cè)序技術(shù)測(cè)定半夏及其偽品的18SrRNA基因核苷酸序列并作序列變異和選擇性內(nèi)切酶譜（PCR-SR）分析，為半夏正品鑒別提供分子依據(jù)。此外，該技術(shù)還可以用于中藥的品質(zhì)鑒定，仇萍等通過(guò)DNA指紋圖譜從分子水平對(duì)中藥材種質(zhì)進(jìn)行準(zhǔn)確分析，從而為鑒定藥材的真?zhèn)蝺?yōu)劣提供依據(jù)。

三、展望

基因組學(xué)研究已把揭示生命本質(zhì)提高到了一個(gè)全新水平，同樣它在中藥各個(gè)領(lǐng)域的滲透也使中藥發(fā)展有了更廣闊的前景，將推動(dòng)中藥在種材培育、藥材鑒定、機(jī)理闡述和新藥研發(fā)的進(jìn)步，促進(jìn)中藥走出中國(guó)，走向世界。

參考文獻(xiàn)：

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篇(2)

關(guān)鍵詞：證候；基因組；五臟網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)；整體

中圖分類號(hào)：R249 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼：A 文章編號(hào)：1673-7717（2008）04-0826-02

證候是中醫(yī)學(xué)的一個(gè)特有的概念，是辨證論治的核心和精髓。證候的標(biāo)準(zhǔn)化和定量化問(wèn)題一直是中醫(yī)學(xué)的一個(gè)棘手問(wèn)題。在中醫(yī)藥學(xué)現(xiàn)代化的進(jìn)程中，證候的現(xiàn)代化研究也被當(dāng)作了中醫(yī)藥學(xué)現(xiàn)代化的突破點(diǎn)。隨著現(xiàn)代基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的迅猛發(fā)展，中醫(yī)學(xué)界正在掀起結(jié)合的浪潮，隨著人類基因組計(jì)劃的完成和后基因組時(shí)代的到來(lái)為中醫(yī)證候的研究帶來(lái)了新的機(jī)遇，如何實(shí)現(xiàn)“證候-基因組學(xué)”闡釋是目前中醫(yī)藥研究的熱點(diǎn)。

1傳統(tǒng)概念

證候是醫(yī)者對(duì)病人的癥狀、舌脈、病情變化、治療經(jīng)過(guò)、個(gè)體情況、地土方宜等狀況，經(jīng)過(guò)四診八綱的分析，采用某種辨證方法得出的一個(gè)總的概括性結(jié)論；是在疾病發(fā)展過(guò)程中的某一階段的病理概括，可以認(rèn)為證候是人體在疾病發(fā)展過(guò)程中的某一階段的反應(yīng)狀態(tài)。證會(huì)隨著疾病的進(jìn)退而變化，是一個(gè)相對(duì)穩(wěn)定的具有時(shí)間性、階段性、變化性的概念。

2沈自尹院士認(rèn)為的證研究難點(diǎn)

①證是一種功能態(tài)的，可以發(fā)展，可以轉(zhuǎn)化；②證的概念應(yīng)用亦較混亂，靈活性大，辨證可因人而異，只有憑醫(yī)生的分析概括水平；③難以定性、定量、更難以定位。可見中醫(yī)證的研究已成為影響中醫(yī)藥學(xué)發(fā)展的關(guān)鍵問(wèn)題。證是一種有機(jī)綜合的功能態(tài)，由一個(gè)調(diào)控中心及其所屬的眾多分子網(wǎng)絡(luò)所構(gòu)成，作為對(duì)外界反應(yīng)與自我調(diào)節(jié)的基礎(chǔ)。那么這個(gè)網(wǎng)絡(luò)是什么呢？就是五臟網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)。

3五臟網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)

人的形體、臟腑、經(jīng)脈、氣穴、溪骨既有各自不同的功能，又彼此聯(lián)系，內(nèi)外相應(yīng)、六合會(huì)通，共同發(fā)揮整體調(diào)控作用。這些聯(lián)系從內(nèi)環(huán)境來(lái)看，表現(xiàn)為臟與臟之間功能協(xié)同關(guān)系，臟與腑之間的表里關(guān)系，腑與腑之間的相互傳化關(guān)系，臟腑與經(jīng)絡(luò)之間的相互絡(luò)屬關(guān)系，及臟腑與五官、五體、五液之間，臟腑與精、氣、血、津液之間的互藏互用關(guān)系。從外環(huán)境看，表現(xiàn)為五臟系統(tǒng)與自然界之間的授受關(guān)系，與五音、五味、五季、五方的廣泛聯(lián)系，形成了以五行屬性為綱的整個(gè)自然界的網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)。五臟之間密切相關(guān),每一臟都含有其他臟之氣,而每一臟之氣又都滲透到其他臟之中,調(diào)整著相互之間的關(guān)系。五臟之間相互依存,相互制約,每一臟的功能都再與它臟的交互聯(lián)系中發(fā)揮作用。

五臟網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)整體由心系統(tǒng)主宰，與其它各層次系統(tǒng)（子系統(tǒng)）的功能活動(dòng)相互協(xié)調(diào)，使系統(tǒng)整體功能處于有序、協(xié)調(diào)和穩(wěn)定狀態(tài)。五臟功能網(wǎng)絡(luò)并非機(jī)械的、自閉的，而是與時(shí)空聯(lián)系在一起的。

4五臟網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)與基因組網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)

宏觀整體和微觀基因組整體有嚴(yán)密的同一性，宏觀整體規(guī)律和微觀基因組規(guī)律有同一性，宏觀的五臟網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)必然有微觀的基因組網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)相互對(duì)應(yīng)。基因組整體由五臟基因組集團(tuán)構(gòu)成，臟基因組集團(tuán)間的聯(lián)系路線是經(jīng)絡(luò)系統(tǒng)的根源，五臟基因組依靠微觀的經(jīng)絡(luò)系統(tǒng)的聯(lián)系的相互作用形成了一個(gè)生命的統(tǒng)一體。

從證的機(jī)理來(lái)講，證與五臟是密切相關(guān)的；從證與基因組的關(guān)系來(lái)講，基因是里，證是表，證與基因的關(guān)系也是密切的，與基因組內(nèi)部的功能作用路線是有關(guān)。中醫(yī)辨證方法有八綱、六經(jīng)、衛(wèi)氣營(yíng)血、臟腑和三焦辨證等。而證又是有個(gè)體差異的，因而被認(rèn)為與基因型相關(guān)。從基因組的角度講，基因表達(dá)正常與協(xié)調(diào)為“正氣”，反之為“病氣”。1979年根據(jù)著名老中醫(yī)關(guān)幼波的臨床經(jīng)驗(yàn)，將肝病分為8個(gè)主型，36個(gè)亞型。因而證的基因組定位也是有主次的，多點(diǎn)的，與基因組的微觀經(jīng)絡(luò)系統(tǒng)、臟基因塊及其作用調(diào)控途徑有關(guān)。由證可以推出與某組蛋白質(zhì)組有關(guān),而這組蛋白質(zhì)組又與某組基因組相關(guān)，因此可以推出肝臟基因組塊的微細(xì)結(jié)構(gòu)以及證的基因組機(jī)理。證候基因組定位是某些基因之間相互聯(lián)系和表達(dá)量大小。證候的本質(zhì)因此是某些基因組成的網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)。

5證候－基因組研究

為促進(jìn)中醫(yī)藥與現(xiàn)代生命科學(xué)的前沿―基因組學(xué)的溝通，尋求新的研究和發(fā)展領(lǐng)域與途徑，國(guó)家中醫(yī)藥管理局科技教育司于1999 年3 月14-15 日在北京召開了中醫(yī)藥與基因組學(xué)研討會(huì)。在中醫(yī)藥與基因組學(xué)研究相互滲透的可能性中醫(yī)藥與基因組學(xué)結(jié)合的研究領(lǐng)域、基因組學(xué)與中醫(yī)藥交叉滲透的切入點(diǎn)3個(gè)方面進(jìn)行了廣泛的交流，取得“證候-基因組”研究的共識(shí)。“證候-基因組學(xué)”定義為在證候理論指導(dǎo)下，運(yùn)用功能基因組學(xué)的方法，通過(guò)探討證候，特別是同病異證或異病同證時(shí)基因的變異及差異表達(dá)情況，揭示與某一證候形成相關(guān)的所有基因及其功能，從整體基因表達(dá)的水平闡明證候的本質(zhì)。

“證候-基因組”的切入證候的研究也應(yīng)當(dāng)包含基因組的兩個(gè)層次，即證候的單核苷酸多態(tài)研究和證候的基因表達(dá)譜研究。前者應(yīng)從異病同證角度切入，這樣才能發(fā)現(xiàn)與證候的關(guān)系密切的核苷酸多態(tài)，但是研究者要從整體上把握證候與SNP 的關(guān)系，就必須通過(guò)對(duì)全部一千萬(wàn)個(gè)SNP 位點(diǎn)都進(jìn)行基因分型，其難度是相當(dāng)大的。“證候-基因表達(dá)譜”研究主要針對(duì)參與表達(dá)的約3 萬(wàn)個(gè)基因，故從理論上把握證候的整體基因表達(dá)是可行的，因此目前“證候-基因組”研究以“證候-基因表達(dá)譜”為重點(diǎn)。

當(dāng)代有許多中醫(yī)學(xué)者專家比如王米渠先生在努力研究中醫(yī)證候和基因組的結(jié)合，試圖在基因組的研究中揭示出中醫(yī)的證或者證候的本質(zhì)。他們克服了方法論、試驗(yàn)重復(fù)性差、海量數(shù)據(jù)處理等困難，在證候－基因組研究中取得了可喜的一步，為揭示中醫(yī)證候的本質(zhì)為中醫(yī)現(xiàn)代化作出了杰出貢獻(xiàn)。

但是當(dāng)代證候－基因組研究也存在許多的不足，例如：如何證候-基因表達(dá)譜動(dòng)態(tài)中表現(xiàn)出證候的定量變化，基因組圖譜中的基因相互關(guān)系怎樣如何隨著證的逐漸變化而發(fā)展的等等。將基因組圖譜作為證候的本質(zhì)不能說(shuō)明問(wèn)題，似乎有將中醫(yī)走向還原論的可能，已經(jīng)有許多學(xué)者提出了批評(píng)。

6證候－基因組研究的建議

證候－基因組研究作為證候現(xiàn)代化研究的初步，能作出這樣的成果是不能提出任何批評(píng)的，但是為了進(jìn)一步的發(fā)展不能不對(duì)現(xiàn)已經(jīng)作出的成果和經(jīng)驗(yàn)作出應(yīng)有的總結(jié)和審核。

（1）重悟輕測(cè)是中醫(yī)傳統(tǒng)的認(rèn)知方法，中醫(yī)對(duì)人體生理、病理的認(rèn)識(shí)體現(xiàn)了這一點(diǎn)。藏象系統(tǒng)就是通過(guò)直覺提出的。現(xiàn)在的證候－基因組研究看起來(lái)走向了另一極端，沒有和中醫(yī)原來(lái)的優(yōu)點(diǎn)結(jié)合起來(lái)。筆者認(rèn)為，證候－基因組研究應(yīng)該和中醫(yī)基因組學(xué)結(jié)合起來(lái)，將分析測(cè)定和整體思維直覺思維結(jié)合起來(lái)，達(dá)到悟測(cè)并重，在測(cè)定中結(jié)合整體思維，在整體思維中測(cè)定，相互驗(yàn)證。

（2）中醫(yī)學(xué)在觀察分析和研究處理問(wèn)題時(shí)，注重的時(shí)事物的功能、屬性、作用，而不是形態(tài)和結(jié)構(gòu)。基因組整體時(shí)結(jié)構(gòu)和功能的統(tǒng)一，認(rèn)識(shí)基因組整體必須堅(jiān)持功能分析和結(jié)構(gòu)分析的統(tǒng)一，在實(shí)踐中將二者結(jié)合起來(lái)，相互促進(jìn)而快速達(dá)到目的。

（3）基因組是相互聯(lián)系的整體，研究證候基因組必須從基因組整體出發(fā)，基因是整體中的部分，是全息性的部分，從整體出發(fā)才不會(huì)走向還原論，而保持中醫(yī)的整體特色。

（4）中醫(yī)堅(jiān)持臨床研究和試驗(yàn)研究的結(jié)合，證候是基因組的網(wǎng)絡(luò)出現(xiàn)的不和諧的問(wèn)題，臨床有大量的證候都可以利用，可以在證候的研究中發(fā)現(xiàn)深刻的基因組聯(lián)系；把臨床研究與試驗(yàn)研究結(jié)合起來(lái)，相互彌補(bǔ)，利用各種分子生物學(xué)技術(shù)和手段可以發(fā)現(xiàn)基因組內(nèi)的整體聯(lián)系。

證候?qū)W是可以結(jié)合現(xiàn)代的分子生物學(xué)技術(shù)，闡述證候的整體本質(zhì)，讓中醫(yī)學(xué)的整體色彩在新的時(shí)代重新煥發(fā)出新的光輝；否則就可能落后，隨著生命本質(zhì)的研究繼續(xù)深入，中醫(yī)學(xué)就可能被取代。基因組學(xué)是現(xiàn)代生命科學(xué)由還原論走向整體論的節(jié)點(diǎn)，而中醫(yī)基因組學(xué)的建立不但促進(jìn)這種趨勢(shì)，而且可以促進(jìn)中醫(yī)藥學(xué)的現(xiàn)代化發(fā)展。中醫(yī)藥學(xué)只有在結(jié)合吸收了現(xiàn)代科學(xué)的優(yōu)秀還原論優(yōu)勢(shì)，在整體理論指導(dǎo)下分化重新整合而走向新的整體論高峰。

參考文獻(xiàn)

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篇(3)

【Abstract】Based on the foundation of related research at home and abroad， paper summarizes the principle and research strategy， research background， basis and main application of system toxicology. At the same time， to explain its current status a case study of the system is introduced. And we hope to draw sufficient toxicological nutrition from the development of molecular biology and development itself combined with the research of traditional toxicology .

【關(guān)鍵詞】背景；技術(shù)；應(yīng)用；進(jìn)展

【Keywords】background； technology； application； progress

【中圖分類號(hào)】X-0 【文獻(xiàn)標(biāo)志碼】A 【文章編號(hào)】1673-1069（2017）04-0195-02

1 系統(tǒng)毒理學(xué)及其誕生背景

系統(tǒng)毒理學(xué)是近10年來(lái)發(fā)展起來(lái)的一門新興學(xué)科，代表著后基因組時(shí)代毒理學(xué)發(fā)展的新方向。所謂系統(tǒng)毒理學(xué)是指通過(guò)了解機(jī)體暴露后在不同劑量、不同時(shí)點(diǎn)的基因表達(dá)譜、蛋白質(zhì)譜和代謝物譜的改變以及傳統(tǒng)毒理學(xué)的研究參數(shù)，借助生物信息學(xué)和計(jì)算毒理學(xué)技術(shù)ζ浣行整合，從而系統(tǒng)地研究外源性化學(xué)物和環(huán)境應(yīng)激等與機(jī)體相互作用的一門學(xué)科 [1]。

近年來(lái)，生命科學(xué)在新理論和新技術(shù)上有了突飛猛進(jìn)的發(fā)展，一系列“組學(xué)”（omics）應(yīng)運(yùn)而生，如基因組學(xué)（genomics）、蛋白質(zhì)組學(xué)（proteomics）、細(xì)胞組學(xué)（cellomics或cytomics），等新學(xué)科不斷涌現(xiàn)，使人們對(duì)基因和基因組的認(rèn)識(shí)，對(duì)生命本質(zhì)的認(rèn)識(shí)和認(rèn)識(shí)生命、健康的手段取得了重要的進(jìn)展。

另外，傳統(tǒng)的毒理學(xué)研究依然存在許多不足，相對(duì)速發(fā)展的分子生物學(xué)技術(shù)和越來(lái)越多的外源性物質(zhì)，毒理學(xué)的研究方法急待革新。

系統(tǒng)毒理學(xué)的發(fā)展，既有系統(tǒng)生物學(xué)發(fā)展的外在刺激，又有傳統(tǒng)毒理學(xué)在發(fā)展中克服自身不足的內(nèi)在需求。

2 生物學(xué)基礎(chǔ)

2.1 基因組學(xué)

基因組學(xué)是研究基因組的結(jié)構(gòu)、功能及表達(dá)產(chǎn)物的學(xué)科。基因組的產(chǎn)物不僅是蛋白質(zhì)，還有許多復(fù)雜功能的RNA。將基因組學(xué)的方法與技術(shù)應(yīng)用于毒理學(xué)研究領(lǐng)域，稱之為毒物基因組學(xué)（toxicogenomics）。毒物基因組學(xué)的基本方法是通過(guò)觀察生物在接觸毒物后基因表達(dá)譜的變化，篩選毒性相關(guān)基因、揭示毒作用的基因表達(dá)譜、快速篩選毒物、在基因組水平對(duì)化學(xué)物進(jìn)行分類、篩選和檢測(cè)基因多態(tài)性、檢測(cè)基因突變、進(jìn)行安全性評(píng)價(jià)等，從而解決化學(xué)物的聯(lián)合作用、高通量篩選對(duì)人體有毒性作用或者潛在毒作用的化學(xué)物、研究毒作用機(jī)制等毒理學(xué)研究上的關(guān)鍵問(wèn)題[2]。

2.2 轉(zhuǎn)錄組學(xué)（transcriptomics）

轉(zhuǎn)錄組學(xué)是從RNA水平研究基因表達(dá)的情況。轉(zhuǎn)錄組即一個(gè)活細(xì)胞所能轉(zhuǎn)錄出來(lái)的所有RNA的總和，是研究細(xì)胞表型和功能的一個(gè)重要手段。

轉(zhuǎn)錄組譜可以提供什么條件下什么基因表達(dá)的信息，并據(jù)此推斷相應(yīng)未知基因的功能，揭示特定調(diào)節(jié)基因的作用機(jī)制。通過(guò)這種基于基因表達(dá)譜的分子標(biāo)簽，不僅可以辨別細(xì)胞的表型歸屬，還可以用于疾病的診斷。例如：阿爾茨海默病（Alzheimer′sdiseases，AD）中，出現(xiàn)神經(jīng)原纖維纏結(jié)的大腦神經(jīng)細(xì)胞基因表達(dá)譜就有別于正常神經(jīng)元，當(dāng)病理形態(tài)學(xué)尚未出現(xiàn)纖維纏結(jié)時(shí)，這種表達(dá)譜的差異即可以作為分子標(biāo)志直接對(duì)該病進(jìn)行診斷。

2.3 蛋白質(zhì)組學(xué)

闡明生物體各種生物基因組在細(xì)胞中表達(dá)的全部蛋白質(zhì)的表達(dá)模式及功能模式的學(xué)科。包括鑒定蛋白質(zhì)的表達(dá)、存在方式（修飾形式）、結(jié)構(gòu)、功能和相互作用等。

同時(shí)，基因的表達(dá)方式錯(cuò)綜復(fù)雜，相同的一個(gè)基因在不同條件、不同時(shí)期可能會(huì)引起完全不同的作用，并加上翻譯后修飾作用如磷酸化、糖基化、乙酞化、羥基化等，使蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)、功能及活性有動(dòng)態(tài)和復(fù)雜的變異。各種蛋白質(zhì)組技術(shù)的基本步驟均包括樣品蛋白質(zhì)制備、蛋白質(zhì)分離、質(zhì)譜分析、蛋白質(zhì)鑒定和肽質(zhì)量指紋譜或純蛋白質(zhì)裂解離子譜圖數(shù)據(jù)庫(kù)的檢索。

3 系統(tǒng)毒理學(xué)研究進(jìn)展

AndrewCraig應(yīng)用系統(tǒng)毒理學(xué)的方法分析使用噻吡二胺研究大鼠肝中毒的機(jī)理。大劑量的噻吡二胺可導(dǎo)致大鼠肝細(xì)胞的壞死，而原因并不清楚。作者通過(guò)基因組學(xué)，蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)的相關(guān)技術(shù)對(duì)具體的機(jī)理進(jìn)行研究。通過(guò)對(duì)雄性大鼠連續(xù)注射噻吡二胺三天，注射劑量為150mg/kg/d，從血液和肝臟獲得藥物后（兩小時(shí)后），每天連續(xù)24小時(shí)收集尿液。監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)可以對(duì)藥物在肝臟內(nèi)的代謝途徑和轉(zhuǎn)換過(guò)程進(jìn)行解釋。

MichaelWaters構(gòu)想并建立了基于危害或風(fēng)險(xiǎn)評(píng)價(jià)的幾個(gè)毒物數(shù)據(jù)庫(kù)，其建立的第一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)被發(fā)展為環(huán)保局辦公室下面的毒物數(shù)據(jù)庫(kù)。通過(guò)和政府，企業(yè)和科研院所的合作，其建立的毒物數(shù)據(jù)庫(kù)已經(jīng)在毒理學(xué)研究和致癌研究方面發(fā)揮了巨大作用。

EthanYixunXu在研究中，對(duì)雄性大鼠分別進(jìn)行鉑化合物和慶大霉素的染毒實(shí)驗(yàn)。使用MetaCore分析軟件，通過(guò)整合尿液中代謝組學(xué)分析圖像和轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析圖像來(lái)鑒別與腎毒物相關(guān)的生物化學(xué)變化。實(shí)驗(yàn)表明，鉑化合物和慶大霉素可嚴(yán)重影響mRNA合成一些轉(zhuǎn)錄子，而每種轉(zhuǎn)錄子對(duì)應(yīng)一種代謝產(chǎn)物。并進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)了腎臟中的幾個(gè)轉(zhuǎn)錄子可能在誘發(fā)腎病方面承擔(dān)主要媒介作用。

JiangshanWang等基于代謝組學(xué)技術(shù)，通過(guò)液相色譜法和質(zhì)譜分析法對(duì)阿霉素（doxorubicin）作用于大鼠進(jìn)行系統(tǒng)毒理學(xué)研究。然后，通過(guò)方差分析和組分分析方法來(lái)揭示隨劑量和時(shí)間的變化以及在多元變量情況下的相互影響。最后，各種設(shè)計(jì)致毒過(guò)程的代謝分子都可以通過(guò)精準(zhǔn)的高通量試驗(yàn)設(shè)備被鑒定出來(lái)，并據(jù)此推斷關(guān)于阿霉素致毒機(jī)理的假設(shè)。

Mutation Researchs志發(fā)表社論，指出“組學(xué)”是理解和學(xué)習(xí)系統(tǒng)毒理學(xué)的一個(gè)工具。“組學(xué)”技術(shù)可以獲取廣泛的基于基因組學(xué)，轉(zhuǎn)錄組學(xué)，蛋白質(zhì)組學(xué)，代謝組學(xué)的數(shù)據(jù)信息。文章進(jìn)一步指出，利用基因毒理學(xué)方法來(lái)研究系統(tǒng)毒理學(xué)的思路看似很簡(jiǎn)單。社論指出，研究致毒機(jī)理對(duì)于正確評(píng)價(jià)藥物或者環(huán)境化學(xué)物暴露下的風(fēng)險(xiǎn)至關(guān)重要。

DavidJ.Spurgeon研究了使用系統(tǒng)毒理學(xué)的方法來(lái)理解環(huán)境化學(xué)混合物的聯(lián)合作用。有時(shí)候這些模型也有局限性，尤其在毒物發(fā)生相互作用的情況下，模型就不能精準(zhǔn)的做出預(yù)測(cè)了。為了能更好地理解混合毒物的相互作用，一種新的實(shí)驗(yàn)研究框架被建立，這種框架是用于理解化學(xué)生物利用度三部曲的延伸。這個(gè)框架認(rèn)為，化學(xué)混合物的相互作用源于一些過(guò)程，包括①物種進(jìn)化，化學(xué)污染物的轉(zhuǎn)運(yùn)；②污染物在生物體內(nèi)的吸附，消化，分配以及排泄；③化學(xué)污染物在目標(biāo)靶位的粘合程度 [3]。

系統(tǒng)毒理學(xué)是在現(xiàn)代生物技術(shù)發(fā)展的基礎(chǔ)上發(fā)展起來(lái)的，它的出現(xiàn)和發(fā)展為人類研究毒理提供了一種新的思路和方法，也讓人們對(duì)于傳統(tǒng)毒理學(xué)無(wú)能為力的一些命題看到了希望，但作為一門新興的研究領(lǐng)域，他的研究方法并不成熟，研究思路也很模糊。雖然被寄予厚望，但要想從分子生物學(xué)的發(fā)展中汲取足夠營(yíng)養(yǎng)并結(jié)合傳統(tǒng)毒理學(xué)的研究成果發(fā)展壯大自己并為人類健康做出貢獻(xiàn)，還有很長(zhǎng)的路要走。

【參考文獻(xiàn)】

【1】王先良.系統(tǒng)毒理學(xué)及其應(yīng)用.生態(tài)毒理學(xué)報(bào)[J].2006，1（4）：289-293.

篇(4)

功能基因組學(xué)檢測(cè)是功能醫(yī)學(xué)的基礎(chǔ)，疾病的發(fā)生是基因與環(huán)境相互作用的結(jié)果。目前我們可以檢測(cè)人體180多種不同的功能基因，這對(duì)早期發(fā)現(xiàn)功能變化大有幫助，因它們發(fā)生在疾病出現(xiàn)以前。還能幫助我們找到病根。今后還會(huì)發(fā)現(xiàn)更多的功能基因。

當(dāng)今科技發(fā)展飛快，生產(chǎn)環(huán)境亦大有改善，環(huán)境中化學(xué)毒物的污染以低濃度、超低濃度為主，人們以長(zhǎng)期低濃度接觸，慢性、亞慢性輕微中毒多見，而急性中毒少見。因此，要開展功能毒理學(xué)的研究。科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)，在人體中與代謝等功能相關(guān)的基因叫做功能基因，這些基因發(fā)生異常的人，在適當(dāng)?shù)沫h(huán)境，包括外環(huán)境、飲食、生活方式的作用下，就會(huì)出現(xiàn)功能的異常，最終導(dǎo)致疾病。對(duì)功能基因組學(xué)的分析，具有個(gè)性化和發(fā)現(xiàn)疾病前兆的特點(diǎn)。最后通過(guò)特色防護(hù)，補(bǔ)充處方營(yíng)養(yǎng)和相應(yīng)的食物，以及促進(jìn)機(jī)體排出毒素等措施，維護(hù)人體健康。

功能醫(yī)學(xué)有助于治療慢性病，這對(duì)職業(yè)病、慢性中毒的防治有幫助。它雖不是新型醫(yī)學(xué)，但它是醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的新思維，是應(yīng)用現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)，全面了解人與環(huán)境關(guān)系的科學(xué)。它將開辟一個(gè)新時(shí)代，是一門保健

醫(yī)學(xué)。

功能基因組學(xué)又稱后基因組學(xué)，它利用結(jié)構(gòu)基因所提供的信息和產(chǎn)物，發(fā)展和應(yīng)用新的實(shí)驗(yàn)手段，在基因組或系統(tǒng)水平上全面分析基因的功能。經(jīng)功能基因組學(xué)研究，發(fā)現(xiàn)基因功能，并對(duì)突變基因進(jìn)行檢測(cè)。外來(lái)化學(xué)物與生物體相互作用后全基因組表達(dá)的變化，再通過(guò)生物信息學(xué)的方法對(duì)化學(xué)物毒性進(jìn)行全面定性分析，篩選更多的標(biāo)志物，解釋毒物致病機(jī)理。毒理學(xué)一方面探討毒物對(duì)機(jī)體各種組織、細(xì)胞、分子的作用及損害機(jī)制，闡明毒物分子結(jié)構(gòu)與其毒作用之間的關(guān)系。另一方面也研究毒物的體內(nèi)過(guò)程及機(jī)體防御體系對(duì)毒作用的影響。

傳統(tǒng)毒理學(xué)注重中毒和三致作用（致癌、致畸、致突變），功能毒理學(xué)與其的最大區(qū)別是它主要評(píng)價(jià)器官的功能，因此它表現(xiàn)的損害早，損害小且可逆。它具有預(yù)防疾病的作用。

功能毒理學(xué)的檢測(cè)不具侵襲性，但它全面、系統(tǒng)。通過(guò)對(duì)糞便、尿液、唾液、血液及毛發(fā)進(jìn)行分析檢測(cè)，評(píng)估人體的六大功能：① 生理代謝功能分析。② 內(nèi)分泌系統(tǒng)功能分析。③ 營(yíng)養(yǎng)狀況分析。④ 免疫系統(tǒng)分析。⑤ 腸胃道系統(tǒng)分析。⑥ 環(huán)境毒素分析。

功能毒理學(xué)分四步：① 調(diào)查了解。即了解個(gè)人的健康信息。② 檢查分析。通過(guò)調(diào)查，量身設(shè)計(jì)作健康功能醫(yī)學(xué)檢查。③ 干預(yù)改善。根據(jù)檢查數(shù)據(jù)作干預(yù)改善，提升器官功能。④ 保持維護(hù)。在健康顧問(wèn)指導(dǎo)下，改善、促進(jìn)健康。

篇(5)

【關(guān)鍵詞】整體醫(yī)學(xué)；基因組；中醫(yī)心理學(xué)；中醫(yī)基因組學(xué)

1整體醫(yī)學(xué)

整體醫(yī)學(xué)是現(xiàn)代社會(huì)正在興起的一種醫(yī)學(xué)體系，將醫(yī)學(xué)看成一個(gè)有機(jī)整體，從整體上來(lái)認(rèn)識(shí)醫(yī)學(xué)的性質(zhì)、對(duì)象和目的。整體醫(yī)學(xué)與傳統(tǒng)中醫(yī)藥學(xué)在外表近似，但是本質(zhì)有所不同。整體醫(yī)學(xué)從本質(zhì)上說(shuō)，是一種系統(tǒng)論。整體醫(yī)學(xué)就是用整體觀認(rèn)識(shí)醫(yī)學(xué)的各個(gè)要素。而整體醫(yī)學(xué)的整體觀是建立在現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)所認(rèn)識(shí)的所有聯(lián)系的基礎(chǔ)上，從科學(xué)的長(zhǎng)遠(yuǎn)發(fā)展上來(lái)說(shuō)，這是一種弱整體觀，一種綜合論，理論基礎(chǔ)是還原科學(xué)觀。

醫(yī)學(xué)的發(fā)展大致經(jīng)歷了三個(gè)時(shí)代，即經(jīng)驗(yàn)醫(yī)學(xué)時(shí)代、實(shí)驗(yàn)醫(yī)學(xué)時(shí)代和當(dāng)前的整體醫(yī)學(xué)時(shí)代。經(jīng)驗(yàn)醫(yī)學(xué)時(shí)代為自然哲學(xué)醫(yī)學(xué)模式，實(shí)驗(yàn)醫(yī)學(xué)時(shí)代為生物醫(yī)學(xué)模式，而整體醫(yī)學(xué)時(shí)代為生物-心理-社會(huì)醫(yī)學(xué)模式。當(dāng)今醫(yī)學(xué)的特點(diǎn)是處在實(shí)驗(yàn)醫(yī)學(xué)時(shí)代向整體醫(yī)學(xué)時(shí)代的過(guò)渡時(shí)期，整體醫(yī)學(xué)的理論體系尚未正式形成，但已具雛形。現(xiàn)代的整體醫(yī)學(xué)是現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)尤其是生命科學(xué)發(fā)展的結(jié)果，但是生命科學(xué)——基因組學(xué)正在走向完善的基因組聯(lián)系，將來(lái)的發(fā)展必然在基因組的普遍聯(lián)系上證明中醫(yī)的基本理論，所以隨著基因組學(xué)的整體化發(fā)展，以及中醫(yī)學(xué)的跨越式發(fā)展，現(xiàn)代整體醫(yī)學(xué)必然走向更完備的、以中醫(yī)學(xué)為核心的整體醫(yī)學(xué)。

2中醫(yī)學(xué)現(xiàn)代化

整體醫(yī)學(xué)的崛起給中醫(yī)藥學(xué)國(guó)際化帶來(lái)了機(jī)遇，整體醫(yī)學(xué)與中醫(yī)藥學(xué)的關(guān)系是十分密切的。從理論體系看，整體醫(yī)學(xué)的理論與中醫(yī)藥學(xué)的學(xué)說(shuō)實(shí)際上是相通的。如《黃帝內(nèi)經(jīng)》中就提出“人與天地相參”的觀點(diǎn)。

中醫(yī)藥學(xué)其實(shí)就是一門完整的整體醫(yī)學(xué)。中醫(yī)學(xué)有著對(duì)人體自身整體性及人與自然、社會(huì)環(huán)境相統(tǒng)一的認(rèn)識(shí)。但是中醫(yī)學(xué)又是一門模糊的整體科學(xué)。《黃帝內(nèi)經(jīng)》建立于二千多年前，是古人觀察人體與自然所建立的整體醫(yī)學(xué)，其本質(zhì)就是結(jié)構(gòu)與功能相統(tǒng)一的整體觀，但是由于社會(huì)發(fā)展水平和極端落后的科學(xué)技術(shù)條件的限制，這個(gè)時(shí)候形成的整體只能是粗略與模糊的。隨著時(shí)代的發(fā)展，由于封建禮教的限制，加之受中國(guó)哲學(xué)觀重用輕體、重道輕器價(jià)值取向的影響，人們開始疏于人體具體的形態(tài)和結(jié)構(gòu)，歧視人體解剖，對(duì)人體的細(xì)節(jié)和局部方面未做較深入的剖析研究，隨之《內(nèi)經(jīng)》的結(jié)構(gòu)功能統(tǒng)一的整體觀逐漸演變?yōu)閱渭兊墓δ苄缘恼w觀。由于缺乏了結(jié)構(gòu)和形態(tài)的支持，不能得到有效的可見的物質(zhì)證據(jù)來(lái)說(shuō)明自己的科學(xué)性，本身也缺乏創(chuàng)新發(fā)展，所以隨著以結(jié)構(gòu)為主的現(xiàn)代醫(yī)學(xué)的發(fā)展，中醫(yī)學(xué)屢次受到打擊和排斥。

中醫(yī)藥學(xué)的發(fā)展必須從《黃帝內(nèi)經(jīng)》的整體思想開始做起，真正認(rèn)識(shí)整體的本質(zhì)，結(jié)合現(xiàn)達(dá)的科學(xué)技術(shù)尤其是分子生物學(xué)技術(shù)，發(fā)展新時(shí)代的完整的結(jié)構(gòu)與功能統(tǒng)一的整體觀。所謂中醫(yī)現(xiàn)代化就是用現(xiàn)代語(yǔ)言和科學(xué)技術(shù)重新描述人與自然、人與社會(huì)平衡條件下的人整體的運(yùn)動(dòng)規(guī)律。

當(dāng)代分子生物學(xué)在迅猛發(fā)展，借助電子計(jì)算機(jī)技術(shù)處理大量數(shù)據(jù)，基因組學(xué)得到了極大的發(fā)展。在足夠的時(shí)間內(nèi)，基因組學(xué)很可能走向整體，最后可能在基因的相互聯(lián)系中發(fā)現(xiàn)了中醫(yī)的陰陽(yáng)五行所存在的基因證據(jù)，這時(shí)候中醫(yī)就會(huì)被分子生物學(xué)所吸收，現(xiàn)代的整體醫(yī)學(xué)就可能吸收了中醫(yī)藥學(xué)的優(yōu)勢(shì)發(fā)展成為完善的結(jié)構(gòu)與功能統(tǒng)一的整體醫(yī)學(xué)，中醫(yī)不再是中國(guó)的中醫(yī)了。這是好事，但是對(duì)于國(guó)家和民族，對(duì)于中醫(yī)學(xué)的發(fā)源地，我們將失去一次崛起的機(jī)會(huì)。

3整體的含義

中醫(yī)學(xué)是整體科學(xué)，西醫(yī)學(xué)是還原科學(xué)。中醫(yī)現(xiàn)代化首先必須是基礎(chǔ)理論的現(xiàn)代化，而基礎(chǔ)理論的現(xiàn)代化又以整體為前提，整體觀的現(xiàn)代化為首要。以前中醫(yī)現(xiàn)代化的失敗在于從傳統(tǒng)的功能整體觀方法論上而不是從整體的根本意義上看待現(xiàn)代化。而西醫(yī)也是從自身的方法論上看待中醫(yī)，所以在這種前提下根本的中西醫(yī)結(jié)合是不可能的。

整體是物質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能的統(tǒng)一，兩者互相依存、不能分離，結(jié)構(gòu)是功能的基礎(chǔ)，功能是結(jié)構(gòu)的展現(xiàn)。整體是局部的整體，局部是整體的局部。整體是物質(zhì)形、氣、能的統(tǒng)一，是結(jié)構(gòu)與功能的統(tǒng)一，是一種客觀實(shí)在。

任何個(gè)體都是由兩種以上的物質(zhì)要素混化而成的。這一混化物可以呈質(zhì)地均勻無(wú)別的氣態(tài)，也可以呈實(shí)體存在的實(shí)體態(tài)。前者固然是一體，后者，盡管它的實(shí)體組成部分可以形形，各部分的功能也可千差萬(wàn)別，但該實(shí)體物的氣卻遍布全體、貫穿內(nèi)外，使組元形成有機(jī)聯(lián)系的和諧整體。這里所說(shuō)的整體，指形成氣的時(shí)空結(jié)構(gòu)而言，它是維系氣獨(dú)立性、特殊性的根本，也可把整體理解為氣的結(jié)構(gòu)模式。譬如，設(shè)某模式為特殊的比附，這種特定的形狀結(jié)構(gòu)的性質(zhì)是不受其所占位置的大小影響的。因而時(shí)空結(jié)構(gòu)模式一旦形成，不僅可以使全部事物的各個(gè)部分都處在同一結(jié)構(gòu)上，而且這一整體特以滲透到所屬各個(gè)局部中去，使在這一整體中的局部組元可以體現(xiàn)整體，這是與組元作為獨(dú)立存在物的根本區(qū)別：①整體的實(shí)在性。②整體的聯(lián)系性：任何整體都在和其他整體處在密切的聯(lián)系當(dāng)中，聯(lián)系是這個(gè)整體存在的必然條件，沒有聯(lián)系便沒有這個(gè)整體存在的必然性了。③整體的層次性：任何整體都是大的整體的一個(gè)組成部分，而這個(gè)整體有包含了小的層次的整體，小的局部組成。④整體規(guī)律的類似性：一物生來(lái)有一身，一物自有一乾坤。每個(gè)整體都是從類似規(guī)律演化而來(lái)，從無(wú)極演化，有太極，從這太極演化陰陽(yáng)，以至這一整體全部。⑤整體的進(jìn)化性：宇宙從無(wú)極逐漸演化太極，以至現(xiàn)在的萬(wàn)物，在發(fā)展至人這個(gè)宇宙最高級(jí)的生命個(gè)體，便是整體演化的最好的證明。

氣是中醫(yī)學(xué)的核心。現(xiàn)代醫(yī)學(xué)是從有形的結(jié)構(gòu)上研究，形是氣所聚，形散為氣，氣是形的場(chǎng)，形氣是統(tǒng)一的。氣是整體的體現(xiàn)。那么從形氣理論的兩種醫(yī)學(xué)也是可以統(tǒng)一的。

整體性是貫穿人體宏觀和微觀的根本。從宏觀逐漸微觀，每一層次都是結(jié)構(gòu)和功能的統(tǒng)一，每一層次都服從統(tǒng)一的整體性，而整體性是每一層次運(yùn)動(dòng)聯(lián)系的根本。這個(gè)的整體規(guī)律就是中醫(yī)基礎(chǔ)理論，這個(gè)規(guī)律指導(dǎo)著每一層次的運(yùn)動(dòng)和相互作用。

4建立中醫(yī)基因組學(xué)

基因組是現(xiàn)代生物學(xué)還原到分子的體現(xiàn)，由此生命科學(xué)開始轉(zhuǎn)向整體科學(xué)。現(xiàn)在的功能基因組學(xué)就是這一轉(zhuǎn)向的體現(xiàn)。基因組是整體科學(xué)與還原科學(xué)的交匯點(diǎn)。

基因組是人體的微觀信息調(diào)控中心，更體現(xiàn)了人體的整體性。它是人的精氣的凝聚態(tài)，含有生命的全部信息。宏觀人體整體和微觀的人體基因組整體性是統(tǒng)一的和同源的，基因組整體是由五臟功能模塊組成，這五臟又有亞細(xì)的模塊組成，這亞細(xì)的模塊又有更微小的基因模塊組成，各個(gè)大模塊亞細(xì)模塊之間存在協(xié)調(diào)的相互關(guān)系，這個(gè)關(guān)系就是微觀經(jīng)絡(luò)系統(tǒng)。基因功能模塊由相應(yīng)的基因組成，基因組整體是結(jié)構(gòu)和功能統(tǒng)一的整體。建立中醫(yī)特色的基因組學(xué)是為了完善中醫(yī)藥學(xué)理論，發(fā)展整體醫(yī)學(xué)。建立微觀基因組整體辨證論治，并沒有否定傳統(tǒng)意義上的辨證論治觀，而是將其發(fā)展一步，深入到基因組整體內(nèi)部，將整體觀深入到基因組整體中，將宏觀整體辨證和微觀基因組整體辨證結(jié)合起來(lái)，建立了一個(gè)從外至里、從里至外的整體的辨證論治觀，建立宏觀和微觀統(tǒng)一的整體的辨證體系。這才是科學(xué)的完整的辨證論治觀。

建立中醫(yī)基因組學(xué)是為了在基因研究的基礎(chǔ)上，結(jié)合證候研究，證明中醫(yī)證候理論的正確性；進(jìn)而在分子基礎(chǔ)上證明中醫(yī)臟腑經(jīng)絡(luò)理論的正確性，最后深入基因組研究，深入了解基因組所蘊(yùn)含的生命本質(zhì)以及生命的發(fā)展。

中醫(yī)基因組學(xué)的建立是中醫(yī)現(xiàn)代化走向未來(lái)的一個(gè)關(guān)鍵點(diǎn)，整體科學(xué)與還原科學(xué)都在這一尖端領(lǐng)域進(jìn)行著研究，而中醫(yī)學(xué)進(jìn)入這一領(lǐng)域，一可以完善自己的理論體系，解譯基因組所包含的全部生命信息，促進(jìn)人類的健康事業(yè)；二則可以引導(dǎo)還原科學(xué)的整體化演變。

5中醫(yī)心理學(xué)的發(fā)展

這是中醫(yī)心理學(xué)與現(xiàn)代心理學(xué)結(jié)合的關(guān)鍵點(diǎn)。也是中醫(yī)現(xiàn)代化的另一個(gè)關(guān)鍵點(diǎn)。

中醫(yī)心理學(xué)原來(lái)是中醫(yī)學(xué)的一個(gè)分支，以心理的整體功能為本體論述人的心理的，講的是人的先天功能。傳統(tǒng)中醫(yī)學(xué)建立在遠(yuǎn)古極端落后的社會(huì)經(jīng)濟(jì)條件下，人們看不出人的社會(huì)本質(zhì)和社會(huì)發(fā)展，而現(xiàn)代社會(huì)條件下，人的心理與健康都受到了社會(huì)的極大影響，發(fā)生了很大改變，中醫(yī)心理學(xué)也必須隨時(shí)代的發(fā)展而發(fā)展。

現(xiàn)代心理學(xué)是以人的大腦的具體結(jié)構(gòu)為生理基礎(chǔ)，論述人在社會(huì)中的各種行為性格等，這是人的后天功能，對(duì)人們的各種行為意識(shí)均有科學(xué)的描述。但是現(xiàn)代心理學(xué)沒有與人的整體功能結(jié)合在一起，沒有指出人的根本的社會(huì)本質(zhì)，所以其發(fā)展也是有局限的。現(xiàn)代心理學(xué)是建立在還原論基礎(chǔ)上的，而人的心理是整體的，所以它本身具有很大的缺陷。

人的各種語(yǔ)言、行為以及意識(shí)思維等都是在人的元神的支配下進(jìn)行的，元神是最根本的自我。而心理的進(jìn)行是在社會(huì)背景條件下的，一切心理行為都有社會(huì)背景的，社會(huì)背景形成了人的心理模塊、人格模式，人格模式下的元神系統(tǒng)構(gòu)成了人的社會(huì)自我，心理的行為是在元神的支配下通過(guò)心理模塊進(jìn)行的，以此結(jié)合這兩個(gè)心理學(xué)，可以從根本上解決人的心理問(wèn)題。佛學(xué)對(duì)人的心性理論有深刻認(rèn)識(shí)，但是借鑒之前必須徹底拋棄佛學(xué)所具有的唯心思想，心性理論中性與元神相關(guān)，而心與元神、元神支配下形成的人格模式有關(guān)。

元神可以接受信息，加工、儲(chǔ)存、提取信息，發(fā)放信息三個(gè)方面。人出生時(shí)意識(shí)是白凈的，但是在人從出生開始，人就在不斷接受信息，在一定社會(huì)文化背景下不斷學(xué)習(xí)，不斷加深信息，積累信息，使元神中的信息不斷強(qiáng)化與激活而得到強(qiáng)化，最終形成了比較固定的人格參照模式。這個(gè)模式一旦形成，就形成了新進(jìn)入信息的文化背景，形成了人各種意識(shí)、行為的模板，形成了特定的性格模式。人的性格模式是在元神支配下形成的，但是性格模式一旦形成就對(duì)人的元神人的生理發(fā)生作用，形成了人的后天行為的文化背景和模式。人的性格模式與人的后天社會(huì)文化環(huán)境有很大關(guān)系，它也不是固定不變的。

中醫(yī)心理學(xué)和現(xiàn)代心理學(xué)是功能與應(yīng)用的結(jié)合。元神是人的整體功能，人的五臟情志、七情等都是人的元神功能的一個(gè)方面，但是這些情志的發(fā)生必然受到人的性格模式的影響，性格模式又決定了情志的發(fā)生模式。中醫(yī)心理學(xué)和現(xiàn)代心理學(xué)都是不完整的，各講述了人心理的一個(gè)方面，結(jié)合起來(lái)才是真正的人的心理整體過(guò)程。

人的心理在當(dāng)今社會(huì)是一個(gè)比較陌生的領(lǐng)域，佛學(xué)、現(xiàn)代心理學(xué)、中醫(yī)心理學(xué)都有各自的認(rèn)識(shí)，但是它們又不是完全的，正確的認(rèn)識(shí)是將它們結(jié)合起來(lái)，建立科學(xué)的辨證唯物主義的整體的心理學(xué)體系。現(xiàn)代中醫(yī)心理學(xué)的建立不但解決了人的意識(shí)的根本問(wèn)題，促進(jìn)人類的心理健康發(fā)展，而是還對(duì)社會(huì)的發(fā)展有很大的潛在的作用。

6結(jié)論

篇(6)

基因工程的發(fā)展促使它成為生命科學(xué)研究的核心學(xué)科。一般高校都將基因工程這門課作為專業(yè)必修課在大三的第二學(xué)期開設(shè)，其先修課程為生物化學(xué)、遺傳學(xué)以及分子生物學(xué)等。基因工程的課程內(nèi)容具有兩個(gè)特點(diǎn):一是教學(xué)內(nèi)容與其他學(xué)科緊密相連。基因工程不僅與生物化學(xué)等基礎(chǔ)課程的內(nèi)容相互聯(lián)系、交叉重疊，同時(shí)又與細(xì)胞工程、蛋白質(zhì)工程、微生物工程等應(yīng)用性課程相互呼應(yīng)與銜接。二是內(nèi)容涵蓋面廣，更新發(fā)展快。隨著人類基因組計(jì)劃的完成，生命科學(xué)的研究已經(jīng)由基因組時(shí)代進(jìn)入到后基因組時(shí)代，單純的基因測(cè)序以及基因工程技術(shù)已經(jīng)不能滿足人類對(duì)生命信息的探索與追求。后基因組時(shí)代到來(lái)的標(biāo)志就是功能基因組學(xué)研究的興起。功能基因組學(xué)研究涉及轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組以及代謝組等多個(gè)方面，多學(xué)科的交叉研究使其發(fā)展迅速。綜上兩個(gè)特點(diǎn)，為了避免課程知識(shí)上的教學(xué)重復(fù)，同時(shí)又能在有限的教學(xué)課時(shí)內(nèi)將基礎(chǔ)知識(shí)與最新、最前沿的研究信息最大程度地傳授給學(xué)生，筆者對(duì)課程的教學(xué)內(nèi)容及其對(duì)應(yīng)的教學(xué)課時(shí)進(jìn)行適當(dāng)?shù)恼{(diào)整。以往的基因工程教學(xué)內(nèi)容共有11章32學(xué)時(shí)，可歸納為4個(gè)部分:第1章，基因工程學(xué)發(fā)展歷史概述、基因工程的基本概念(4課時(shí));第2、3章，基因工程的基本原理及技術(shù)，主要圍繞基因工程的基本構(gòu)件載體和工具酶(12課時(shí));第4～10章，基因工程實(shí)施的三大步驟，包括DNA體外重組、重組DNA導(dǎo)入宿主細(xì)胞后擴(kuò)增和表達(dá)以及基因工程后處理(12課時(shí));第11章，基因工程的應(yīng)用與前景(4課時(shí))。筆者在此基礎(chǔ)上對(duì)教學(xué)內(nèi)容進(jìn)行了適當(dāng)合理的取舍與增加，做到突出重點(diǎn)，加強(qiáng)基本概念和原理的理解，通過(guò)列舉實(shí)際應(yīng)用研究來(lái)介紹相關(guān)的技術(shù)與方法。同時(shí)整合課時(shí)分布，在原有的32課時(shí)中拿出8課時(shí)介紹功能基因組學(xué)研究的知識(shí)。其內(nèi)容主要圍繞克隆與表達(dá)后的目的產(chǎn)物(蛋白質(zhì))的提取、分離、純化與鑒定的方法、原理以及技術(shù)。調(diào)整后的課程安排如表1。通過(guò)此番改革教學(xué)內(nèi)容，一方面可以開拓學(xué)生的視野，幫助學(xué)生了解基因工程以及功能基因組學(xué)的理論知識(shí)和實(shí)際應(yīng)用領(lǐng)域;另一方面也可以激發(fā)學(xué)生學(xué)習(xí)基因工程的積極性與主動(dòng)性。

2教學(xué)手段與方法的改良

傳統(tǒng)的基因工程教學(xué)方法在水產(chǎn)類高等學(xué)校中多以板書結(jié)合多媒體的方法來(lái)講解概念、原理以及性質(zhì)等內(nèi)容，其過(guò)程相對(duì)機(jī)械、枯燥，使得學(xué)生難以理解所學(xué)內(nèi)容。對(duì)此，筆者通過(guò)多媒體教學(xué)與自制模型演示相結(jié)合的方法取代原有的傳統(tǒng)教學(xué)。由于基因工程的很多內(nèi)容相對(duì)抽象，僅僅通過(guò)文字、圖片和語(yǔ)言來(lái)表述是難以講解透徹的。現(xiàn)代的多媒體教學(xué)技術(shù)具有圖文聲像隨意組合、靈活多變的特點(diǎn)，為學(xué)生創(chuàng)造了良好的學(xué)習(xí)情境。通過(guò)功能強(qiáng)大的各種計(jì)算機(jī)軟件把一些很難理解的內(nèi)容做成動(dòng)畫影片，化難為易、化靜為動(dòng)、變抽象為形象，使學(xué)生對(duì)上課產(chǎn)生興趣，促進(jìn)學(xué)生對(duì)知識(shí)學(xué)習(xí)的渴望。同時(shí)，利用自制的模型講解課程中的重點(diǎn)以及難點(diǎn)。例如:在介紹限制酶的切割位點(diǎn)時(shí)，讓學(xué)生手持模型，分別角色扮演限制酶和基因序列，在排列位置的互換中了解3種切口的方式以及位置。這樣的教學(xué)方法不僅形象，也讓學(xué)生在互動(dòng)中快速、深刻地記憶知識(shí)要點(diǎn)。另外，通過(guò)當(dāng)下研究的前沿話題為例，先提出一個(gè)問(wèn)題，引導(dǎo)學(xué)生運(yùn)用其他課程所學(xué)過(guò)的或者自身所積累的知識(shí)來(lái)聯(lián)想、分析、討論，自己設(shè)計(jì)解答此問(wèn)題的方法或?qū)嶒?yàn)流程。然后老師再參與其中，在討論和修改方法以及實(shí)驗(yàn)流程的過(guò)程中，引出所要講授的新的概念和知識(shí)要點(diǎn)。

例如介紹表達(dá)物質(zhì)(蛋白質(zhì))的鑒定時(shí)，老師會(huì)先提出問(wèn)題:基因克隆表達(dá)出的物質(zhì)是什么?這些物質(zhì)是由什么組成的?鑒定這些物質(zhì)可以使用什么方法?然后引導(dǎo)學(xué)生回顧生物學(xué)中心法則，得出基因表達(dá)物質(zhì)為蛋白質(zhì)，蛋白質(zhì)是由氨基酸組成等所學(xué)過(guò)的知識(shí)，由此學(xué)生可歸納出氨基酸測(cè)序法等鑒定蛋白質(zhì)的方法。最后老師再在此基礎(chǔ)上補(bǔ)充出WesternBlot法、生物質(zhì)譜技術(shù)等新的鑒定方法。這樣的講課方式讓學(xué)生回到課堂上的主角位置，在復(fù)習(xí)了以往的知識(shí)要點(diǎn)的同時(shí)也加深了學(xué)生對(duì)新知識(shí)的理解與記憶，在一定程度上啟發(fā)了學(xué)生如何去發(fā)現(xiàn)問(wèn)題和解決問(wèn)題。此外，基因工程是一門實(shí)踐性很強(qiáng)的課程，在講授理論課的同時(shí)，實(shí)驗(yàn)課的安排也是非常重要的。設(shè)計(jì)好與理論課相配套的實(shí)驗(yàn)課程，可以使學(xué)生加深對(duì)基因工程學(xué)理論的學(xué)習(xí)和理解，達(dá)到理論和實(shí)踐相結(jié)合的目的。對(duì)此，各大高校均在基因工程實(shí)驗(yàn)課上進(jìn)行了改革創(chuàng)新，但有一點(diǎn)總被忽略，那就是實(shí)驗(yàn)研究對(duì)象。目前，國(guó)內(nèi)大多數(shù)高校基因工程實(shí)驗(yàn)課所使用的研究對(duì)象均為果蠅等無(wú)脊椎模式生物。這種情況對(duì)于普通高校而言是可行的，但是對(duì)于擁有特色學(xué)科的水產(chǎn)類高校而言，研究對(duì)象也應(yīng)具有其專業(yè)特點(diǎn)。所以本實(shí)驗(yàn)課所使用的研究對(duì)象是斑馬魚這種海洋模式生物。研究對(duì)象的改變雖微不足道，但是能讓學(xué)生更好地理解自己所學(xué)專業(yè)的特色，在實(shí)踐操作中加深對(duì)所屬專業(yè)的熱愛。

3成績(jī)考核

中國(guó)傳統(tǒng)的應(yīng)試教育產(chǎn)生了“高分決定一切”的迂腐思想。隨著國(guó)家教育體系改革的不斷推進(jìn)，學(xué)生對(duì)于專業(yè)知識(shí)的掌握與否，已經(jīng)不能僅從一張考卷成績(jī)的高低來(lái)反映，考核成績(jī)的結(jié)構(gòu)應(yīng)向多元化的方向發(fā)展。基因工程的最終考核成績(jī)主要包括兩部分:平時(shí)成績(jī)占40%，其中課堂出勤率10%、課堂討論10%、課堂小考10%以及實(shí)驗(yàn)報(bào)告10%;期末考試成績(jī)占60%。這樣的考核體系改變了過(guò)去注重結(jié)果忽略過(guò)程的做法，讓學(xué)生在平時(shí)將知識(shí)一點(diǎn)一滴地積累起來(lái)。同時(shí)，也讓授課教師能夠及時(shí)得到教學(xué)效果的反饋信息，進(jìn)一步提高教學(xué)水平。

4結(jié)語(yǔ)

篇(7)

與傳統(tǒng)的第一代測(cè)序，又稱Sanger測(cè)序相比，在DNA測(cè)序方面，HTS技術(shù)具有快速、廉價(jià)和高通量的優(yōu)點(diǎn)，使得細(xì)菌基因組學(xué)研究發(fā)生了巨大的變化。高通量“臺(tái)式”測(cè)序儀的出現(xiàn)的使實(shí)驗(yàn)室能夠獨(dú)立于專業(yè)測(cè)序中心進(jìn)行測(cè)序工作，同時(shí)，HTS高分辨率的特點(diǎn)可以確定病原菌克隆的分子機(jī)制，輔助研究人員推斷出全球大流行以及局部暴發(fā)期間的傳播途徑，甚至可以對(duì)患者個(gè)體在感染期間進(jìn)行細(xì)菌種群進(jìn)化分析。與傳統(tǒng)的雜交方法相比，HTS還提供了轉(zhuǎn)錄組分析的潛力，包括覆蓋全基因組范圍及準(zhǔn)確定量等，且深度測(cè)序輔助對(duì)細(xì)菌突變體文庫(kù)的構(gòu)建，以確定病原菌在體內(nèi)生長(zhǎng)或在其他特定生長(zhǎng)條件下存活所需的決定因素。本文將對(duì)HTS在細(xì)菌病原體方面的近期研究進(jìn)展進(jìn)行闡述。

一、感染過(guò)程中細(xì)菌進(jìn)化的研究

感染性疾病的進(jìn)展和結(jié)果往往取決于宿主與病原體如何相互作用，采用HTS技術(shù)進(jìn)行的研究為定殖和感染過(guò)程中細(xì)菌病原體的進(jìn)化提供了新的見解。例如，研究發(fā)現(xiàn)，在感染過(guò)程中，由于選擇性壓力（例如與其他微生物共同感染、宿主的免疫反應(yīng)及抗生素的應(yīng)用等），某些固定的亞種中會(huì)隨機(jī)出現(xiàn)有利與病原菌的突變，同時(shí)，在感染期間還可以發(fā)生抗生素耐藥性的突變。相較于與傳統(tǒng)的PCR擴(kuò)增技術(shù)和一代Sanger測(cè)序，HTS的超基因組學(xué)方法可以從微生物群分析得到更大的多樣性。例如，與健康者相比，肺囊性纖維化患者的微生物多樣性降低與更嚴(yán)重的炎癥相關(guān)，并且微生物的代謝途徑的明顯發(fā)生改變。

二、確定疾病暴發(fā)的來(lái)源和傳播途徑

傳統(tǒng)的細(xì)菌分型方法鑒別力較低，無(wú)法在傳染病暴發(fā)的流行病學(xué)調(diào)查中發(fā)揮精準(zhǔn)的作用。全基因組序列可以為分離株之間核苷酸提供最高水平的分辨率，可識(shí)別醫(yī)院內(nèi)部和醫(yī)院之間以及社區(qū)之間的傳播。應(yīng)用該種新方法可以確定傳播的起源是某單一菌株還是多個(gè)菌株共同引起。

三、有助于了解病原性克隆出現(xiàn)的分子基礎(chǔ)

對(duì)大量緊密相關(guān)的分離菌株進(jìn)行測(cè)序可幫助我們重建高分辨率的系統(tǒng)發(fā)育樹，有助于對(duì)病原菌克隆株出現(xiàn)和傳播的潛在過(guò)程進(jìn)行深入了解。例如，基于HTS的進(jìn)化研究，證明了第七次霍亂大流行由三個(gè)獨(dú)立事件組成，后兩個(gè)是由于霍亂弧菌獲取復(fù)方新諾明抗生素耐藥元件造成的，這導(dǎo)致了對(duì)常用霍亂治療的失敗引發(fā)了流行。

四、HTS在了解病原體生物學(xué)方面的未來(lái)應(yīng)用

測(cè)序技術(shù)的飛快發(fā)展，單分子測(cè)序、讀長(zhǎng)不斷的增加使得微生物群落內(nèi)單個(gè)病原體的高